RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 MYOD1P15172 320 aa12.82□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 PRSS8Q16651 343 aa12.82□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 RHOBP62745 196 aa12.81□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 PRCDQ00LT1 54 aa12.81□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 BSPH1Q075Z2 132 aa12.81□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TMEM183BQ1AE95 376 aa12.81□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TOMM20LQ6UXN7 152 aa12.81□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 SSX8Q7RTT4 187 aa12.81□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 STPG3Q8N7X2 389 aa12.81□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TMEM37Q8WXS4 190 aa12.81□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 NEUROG1Q92886 237 aa12.81□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 DSPP15924 2871 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 VSTM5A8MXK1 200 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 IGKV1-16P04430 117 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 THBDP07204 575 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 NBL1P41271 181 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 RPL31P62899 125 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 EFNB3Q15768 340 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 GFRALQ6UXV0 394 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 OR2T10Q8NGZ9 312 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 PPIAL4EA0A075B759 164 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 PPIAL4DF5H284 164 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 PPIAL4FP0DN26 164 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 CD99P14209 185 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 KCNIP4Q6PIL6 250 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 BET1LQ9NYM9 111 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 JKAMPQ9P055 326 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 FUT9Q9Y231 359 aa12.8□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 MT-CO2P00403 227 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 ZNF714Q96N38 554 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 SAP30LQ9HAJ7 183 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 CLEC5AQ9NY25 188 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 ZNRD1Q9P1U0 126 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 ASPMQ8IZT6 3477 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 IGFBP2P18065 325 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 CD33P20138 364 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 GCHFRP30047 84 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 RPS20P60866 119 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 PRR20EP86478 221 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 PRR20CP86479 221 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 PRR20DP86480 221 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 PRR20BP86481 221 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 PRR20AP86496 221 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 CLEC12BQ2HXU8 276 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TMEM204Q9BSN7 226 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 VAMP8Q9BV40 100 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TMEM178BH3BS89 294 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 APOA2P02652 100 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 ARF6P62330 175 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TMEM200BQ69YZ2 307 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 OR5B3Q8NH48 314 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 RND1Q92730 232 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 DERL1Q9BUN8 251 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 DYSFO75923 2080 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 RIPPLY3P57055 190 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 C2orf83Q53S99 150 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TMEM144Q7Z5S9 345 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 Q8NA96 180 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TMEM106BQ9NUM4 274 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 ZNF835Q9Y2P0 537 aa12.78□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 DSCAML1Q8TD84 2053 aa12.77□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 TYMSP04818 313 aa12.77□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 LINC00869P0C866 280 aa12.77□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 CCL3L1P16619 93 aa12.77□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 CCL17Q92583 94 aa12.77□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 IMMP2LQ96T52 175 aa12.77□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 LRFN3Q9BTN0 628 aa12.77□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 SLC45A2Q9UMX9 530 aa12.77□□□□□ -0.36
POP4-201ENST00000221770 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
POP4-201ENST00000221770 NDUFB3O43676 98 aa12.77□□□□□ -0.37
POP4-201ENST00000221770 NUPR1O60356 82 aa12.77□□□□□ -0.37
POP4-201ENST00000221770 LCN2P80188 198 aa12.77□□□□□ -0.37
POP4-201ENST00000221770 ACTL10Q5JWF8 245 aa12.77□□□□□ -0.37
POP4-201ENST00000221770 OR4P4Q8NGL7 312 aa12.77□□□□□ -0.37
POP4-201ENST00000221770 BTF3L4Q96K17 158 aa12.77□□□□□ -0.37
POP4-201ENST00000221770 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
POP4-201ENST00000221770 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.76□□□□□ -0.37
POP4-201ENST00000221770 SCO2A0A1W2PP80 73 aa12.76□□□□□ -0.37
POP4-201ENST00000221770 FOXH1O75593 365 aa12.76□□□□□ -0.37
POP4-201ENST00000221770 TMEM256Q8N2U0 113 aa12.76□□□□□ -0.37
POP4-201ENST00000221770 OR5AN1Q8NGI8 311 aa12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms