RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 NPPCP23582 126 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 C2orf83Q53S99 150 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 DNLZQ5SXM8 178 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 B4DEV8 164 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 TMEM250H0YL14 139 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 SLC25A17O43808 307 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 STAG3L2P0CL84 134 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 STAG3L3P0CL85 134 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 HOXA5P20719 270 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 ADIRFQ15847 76 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 NAT8Q9UHE5 227 aa14.62□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 SOX15O60248 233 aa14.61□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 ZNF124Q15973 351 aa14.61□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.61□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.61□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.61□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 S100A2P29034 98 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 PRR20EP86478 221 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 PRR20CP86479 221 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 PRR20DP86480 221 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 PRR20BP86481 221 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 PRR20AP86496 221 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 WT1-ASQ06250 92 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 GAMTQ14353 236 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 CST9LP1Q5W188 147 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 LINC00869P0C866 280 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 COX7A1P24310 79 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 RPS10P46783 165 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 HECTD1Q9ULT8 2610 aa14.6□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 CXorf65A6NEN9 183 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 FOXH1O75593 365 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 IGLV1-47P01700 117 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 CNTFRP26992 372 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 CCL19Q99731 98 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 FNDC10F2Z333 226 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 ACTL6BO94805 426 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 IL3RAP26951 378 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 RAB31Q13636 194 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 OR4A5Q8NH83 315 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 PFDN5Q99471 154 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.59□□□□□ -0.07
USP18-201ENST00000215794 CXorf1O96002 111 aa14.58□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 GNB1P62873 340 aa14.58□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 DEFA6Q01524 100 aa14.58□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 CD69Q07108 199 aa14.58□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.58□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 DERL1Q9BUN8 251 aa14.58□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 APCP25054 2843 aa14.58□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 SVEP1Q4LDE5 3571 aa14.58□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.58□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 C22orf46C9J442 243 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 REG1AP05451 166 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 OR10J1P30954 320 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 MC5RP33032 325 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 OR8B2Q96RD0 313 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 CLDN34H7C241 214 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 FSTL3O95633 263 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 IGHV3-48P01763 117 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 RHOBP62745 196 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 PLXNB1O43157 2135 aa14.57□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 GCHFRP30047 84 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 PRRX1P54821 245 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 FAM78BQ5VT40 261 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 TNFRSF14Q92956 283 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms