RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616502.4

EPHB4-210, Transcript of EPH receptor B4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene EPHB4, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4-210ENST00000616502 CD99P14209 185 aa11.95□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF137PP52743 207 aa11.95□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.95□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 OR13A1Q8NGR1 328 aa11.95□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.95□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.95□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.95□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.95□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 IGFBP2P18065 325 aa11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 TCF19Q9Y242 345 aa11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 TMEM140Q9NV12 185 aa11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 LINC00473A8K010 186 aa11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 RELBQ01201 579 aa11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 TREML4Q6UXN2 200 aa11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 CORO2AQ92828 525 aa11.94□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 MPDU1O75352 247 aa11.93□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 TYMSP04818 313 aa11.93□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 TDGF1P13385 188 aa11.93□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 OR2T6Q8NHC8 308 aa11.93□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa11.93□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 SARAFQ96BY9 339 aa11.93□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.93□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 PROCRQ9UNN8 238 aa11.93□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 COX7A2P2O60397 106 aa11.93□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 ZFP30Q9Y2G7 519 aa11.93□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 C15orf62A8K5M9 175 aa11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 RPL15P61313 204 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 RND1Q92730 232 aa11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 CHEK1O14757 476 aa11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 GFRA1P56159 465 aa11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 Q6P435 159 aa11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.92□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 MT-ND6P03923 174 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 KIR2DL5AQ8N109 375 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 EFNB3Q15768 340 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF718Q3SXZ3 478 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 OR8B2Q96RD0 313 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 NABP2Q9BQ15 211 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 C10orf142B7Z368 130 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 GPX1P07203 203 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 LINC00614P0C842 121 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 C3orf79P0CE67 100 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 OPRK1P41145 380 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 PDLIM4P50479 330 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 STPG4Q8N801 248 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 OR4S2Q8NH73 311 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 PLXNB1O43157 2135 aa11.91□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 J3QR06 171 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 K7EM74 188 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 CA2P00918 260 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 HLA-DQA1P01909 254 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 APELAP0DMC3 54 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 PSG7Q13046 419 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 C1orf174Q8IYL3 243 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 C9orf106Q8NAJ2 232 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 MGST2Q99735 147 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 METRNQ9UJH8 293 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 SNAI2O43623 268 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 ENSAO43768 121 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 STAG3L2P0CL84 134 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 STAG3L3P0CL85 134 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 MYOD1P15172 320 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 ORM2P19652 201 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 CCL8P80075 99 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 FAM27E3Q08E93 113 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 OR4A47Q6IF82 309 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 KCNS1Q96KK3 526 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 H3BTX0 84 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 FAM87AP0C7U9 286 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 PRDX2P32119 198 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 SELENOVP59797 346 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 COLCA1Q6ZS62 124 aa11.9□□□□□ -0.5
EPHB4-210ENST00000616502 SSX8Q7RTT4 187 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms