RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608657.5

ITGB5-212, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-212ENST00000608657 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 FAM74A7A6NL05 159 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 AGPAT2O15120 278 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 TNFSF12O43508 249 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 MPDU1O75352 247 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 PROP1O75360 226 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 IGKV1D-33P01593 117 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 IGKV1-33P01594 117 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 IGLV2-14P01704 120 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 CT45A6P0DMU7 189 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 CT45A5P0DMU8 189 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 CT45A7P0DMV0 189 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 ADCYAP1P18509 176 aa7.12□□□□□ -1.27
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ITGB5-212ENST00000608657 CD1BP29016 333 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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ITGB5-212ENST00000608657 PMS2P11Q13670 270 aa7.12□□□□□ -1.27
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ITGB5-212ENST00000608657 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.12□□□□□ -1.27
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ITGB5-212ENST00000608657 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.12□□□□□ -1.27
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ITGB5-212ENST00000608657 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 TCF19Q9Y242 345 aa7.12□□□□□ -1.27
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ITGB5-212ENST00000608657 H0YJW9 148 aa7.11□□□□□ -1.27
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ITGB5-212ENST00000608657 A6NDX4 124 aa7.09□□□□□ -1.27
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ITGB5-212ENST00000608657 FCGR3BO75015 233 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 IGKV1-5P01602 117 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 S100A8P05109 93 aa7.09□□□□□ -1.27
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ITGB5-212ENST00000608657 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 RAB11AP62491 216 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 EBI3Q14213 229 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 MMDQ15546 238 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGB5-212ENST00000608657 ZNF585BQ52M93 769 aa7.09□□□□□ -1.27
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