RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587547.1

NEDD4L-218, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-218ENST00000587547 CACNG5Q9UF02 275 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 C7orf66A4D0T2 115 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 C5orf51A6NDU8 294 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 LINC01548A6NM66 108 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 C15orf61A6NNL5 157 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 TSPAN9O75954 239 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SIX6O95475 246 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 P0C879 139 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 APELAP0DMC3 54 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 HLA-GP17693 338 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 CX3CL1P78423 397 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 NDPQ00604 133 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SMCO1Q147U7 214 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 ECSCRQ19T08 205 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SPINK9Q5DT21 86 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 NMSQ5H8A3 153 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 Q6ZRM9 215 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM219AQ8IW50 185 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 STPG3Q8N7X2 389 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR4F5Q8NH21 305 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 ARPC1AQ92747 370 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SPIN2AQ99865 258 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 MED28Q9H204 178 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF702PQ9H963 129 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 PRNDQ9UKY0 176 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 DBX1A6NMT0 343 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 MPTX1A8MV57 137 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 ATP6V0E1O15342 81 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 ST8SIA3O43173 380 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 IFNA17P01571 189 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 MAS1LP35410 378 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR10C1Q96KK4 312 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 COL7A1Q02388 2944 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 A0A1B0GU03 582 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 HMX3A6NHT5 357 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 MSGN1A6NI15 193 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 G3V318 75 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 AP4M1O00189 453 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 NDUFA7O95182 113 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 IGHG2P01859 326 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 FGF2P09038 288 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 FCN2Q15485 313 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 Q6ZNX1 250 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 LFNGQ8NES3 379 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 RNF114Q9Y508 228 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 A0A1B0GW64 132 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 CGB1A6NKQ9 187 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 E7EUB6 86 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 REG1AP05451 166 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC25A6P12236 298 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 PRCDQ00LT1 54 aa6.6□□□□□ -1.35
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