RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-218	ENST00000584243	STUM	Q69YW2	141 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ACY3	Q96HD9	319 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	YPEL4	Q96NS1	127 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RSG1	Q9BU20	258 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	DUSP13	Q9UII6	198 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243		A0A1W2PN81	502 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243		A8MXE2	369 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	PPP5D1	E7EU14	171 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243		H7BYZ3	331 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RAMP3	O60896	148 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	FCGR3B	O75015	233 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TGFA	P01135	160 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	FBP1	P09467	338 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CD40	P25942	277 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CHRNA7	P36544	502 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF83	P51522	516 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TAS2R45	P59539	299 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RHOB	P62745	196 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ELOB	Q15370	118 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	BSX	Q3C1V8	233 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TEPP	Q6URK8	271 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	LCN15	Q6UWW0	184 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CD177	Q8N6Q3	437 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	DDB2	Q92466	427 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CYYR1	Q96J86	154 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	FAM210B	Q96KR6	192 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	UHRF2	Q96PU4	802 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RARRES2	Q99969	163 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	MSL2	Q9HCI7	577 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TMEM140	Q9NV12	185 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	BET1L	Q9NYM9	111 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243		A0A1W2PPE2	198 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	C17orf98	A8MV24	154 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	C3orf84	H3BNL1	204 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	WNT9B	O14905	357 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RBP4	P02753	201 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TYMS	P04818	313 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CGB3	P0DN86	165 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CGB7	P0DN87	165 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SLC25A16	P16260	332 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	NPY1R	P25929	384 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	MC5R	P33032	325 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	EDDM3B	P56851	147 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CCL20	P78556	96 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	FAM27E3	Q08E93	113 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	EDDM3A	Q14507	147 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CASC10	Q5T4H9	136 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	REC114	Q7Z4M0	266 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RAB24	Q969Q5	203 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RHOV	Q96L33	236 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	DOCK7	Q96N67	2140 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	LINC00473	A8K010	186 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	C15orf62	A8K5M9	175 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	C11orf94	C9JXX5	98 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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