RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		19.34	■□□□□ 0.69
GPS1-223	ENST00000584229	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		19.34	■□□□□ 0.69
GPS1-223	ENST00000584229	LRTM2	Q8N967	370 aa		19.34	■□□□□ 0.69
GPS1-223	ENST00000584229	OR11H1	Q8NG94	326 aa		19.34	■□□□□ 0.69
GPS1-223	ENST00000584229	DPF1	Q92782	380 aa		19.34	■□□□□ 0.69
GPS1-223	ENST00000584229	USMG5	Q96IX5	58 aa		19.34	■□□□□ 0.69
GPS1-223	ENST00000584229	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		19.34	■□□□□ 0.69
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		19.33	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	19.33	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	19.33	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	19.33	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		19.33	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		19.33	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	NECAP1	Q8NC96	275 aa		19.33	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		19.33	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		19.32	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229		I3L521	148 aa		19.32	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	BRI3	O95415	125 aa		19.32	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	19.32	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	CD33	P20138	364 aa		19.32	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	MYCNOS	P40205	109 aa		19.32	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	C15orf32	Q32M92	178 aa		19.32	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		19.32	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		19.32	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		19.31	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		19.31	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	SPCS3	P61009	180 aa		19.31	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		19.31	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	PLET1	Q6UQ28	207 aa		19.31	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		19.31	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	THYN1	Q9P016	225 aa		19.31	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	19.31	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229		S4R3C0	116 aa		19.31	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		19.3	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	ADAP1	O75689	374 aa		19.3	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFB8	O95169	186 aa		19.3	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	IFNA21	P01568	189 aa		19.3	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV3-23	P01764	117 aa		19.3	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	SNCA	P37840	140 aa		19.3	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF616	Q08AN1	781 aa		19.3	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	OR2C3	Q8N628	320 aa		19.3	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		19.3	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		19.29	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229		A0A087WW49	117 aa		19.29	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GU03	582 aa		19.29	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	RUNX1	Q01196	453 aa		19.29	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	OR52E5	Q8NH55	327 aa		19.29	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	MISP3	Q96FF7	219 aa		19.29	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	19.29	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	LINC01619	G3V211	115 aa		19.28	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	19.28	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		19.28	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	P2RX4	Q99571	388 aa		19.28	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		19.27	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	19.27	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	OR8U8	P0C7N1	319 aa		19.27	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		19.27	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		19.27	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		19.27	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	MITD1	Q8WV92	249 aa		19.27	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		19.27	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		19.27	■□□□□ 0.68
GPS1-223	ENST00000584229	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		19.26	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	SLURP1	P55000	103 aa		19.26	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	TNFRSF9	Q07011	255 aa		19.26	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	AARD	Q4LEZ3	155 aa		19.26	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		19.26	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	OR1P1	Q8NH06	330 aa		19.26	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	19.26	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	19.26	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		19.25	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	19.25	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	MFAP2	P55001	183 aa		19.25	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF114	Q8NC26	417 aa		19.25	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	19.25	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	CXorf58	Q96LI9	332 aa		19.25	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		19.25	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	RBKS	Q9H477	322 aa		19.25	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	VWF	P04275	2813 aa		19.24	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	MPTX1	A8MV57	137 aa		19.24	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	CCS	O14618	274 aa		19.24	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	TRBV12-3	P01733	135 aa		19.24	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A6	P12236	298 aa		19.24	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	FHL3	Q13643	280 aa		19.24	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	DTD1	Q8TEA8	209 aa		19.24	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		19.24	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	FAM25E	A8MYX2	175 aa		19.23	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	SPN	P16150	400 aa		19.23	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		19.23	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		19.23	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	PALMD	Q9NP74	551 aa		19.23	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		19.23	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	PPP5D1	E7EU14	171 aa		19.22	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	SCGB1D2	O95969	90 aa		19.22	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	IL5	P05113	134 aa		19.22	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	19.22	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	RPEL1	Q2QD12	228 aa		19.22	■□□□□ 0.67
GPS1-223	ENST00000584229	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	19.22	■□□□□ 0.67

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