RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	RAB32	Q13637	225 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	ARFRP1	Q13795	201 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM42	Q69YG0	159 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	ELP2	Q6IA86	826 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	STOML3	Q8TAV4	291 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	PP6455	Q8WZ26	134 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	REEP6	Q96HR9	211 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	C2orf50	Q96LR7	162 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	NMES1	Q9C002	83 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	EHF	Q9NZC4	300 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	COMMD9	Q9P000	198 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	PEMT	Q9UBM1	199 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	GHRL	Q9UBU3	117 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	CACNG5	Q9UF02	275 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	AK3	Q9UIJ7	227 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	SOX15	O60248	233 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	TFF1	P04155	84 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	LCAT	P04180	440 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	FCGR3A	P08637	254 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	HOXB5	P09067	269 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM225B	P0DP42	221 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	NR2C1	P13056	603 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	MIF	P14174	115 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	ADCYAP1	P18509	176 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	PRKACB	P22694	351 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	MTCP1	P56278	107 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	TAS2R46	P59540	309 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	FAM3A	P98173	230 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM187	Q14656	261 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	PIGY	Q3MUY2	71 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	TM4SF20	Q53R12	229 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	TCF24	Q7RTU0	167 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	BATF2	Q8N1L9	274 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	THAP6	Q8TBB0	222 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	TMED6	Q8WW62	240 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	SPTSSA	Q969W0	71 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	MARC2	Q969Z3	335 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	C10orf35	Q96D05	121 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	GALNT14	Q96FL9	552 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	LINC01600	Q96MT4	127 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	AQP10	Q96PS8	301 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	METTL9	Q9H1A3	318 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	WFDC1	Q9HC57	220 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MSI2-216	ENST00000582772	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM218	A2RU14	115 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	RAB19	A4D1S5	217 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772		C9JQL5	133 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772		F8W735	103 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772		G3V318	75 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TSPAN4	O14817	238 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	BET1	O15155	118 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	NRAS	P01111	189 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	APOC1	P02654	83 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	APOC3	P02656	99 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PSG2	P11465	335 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	AADAC	P22760	399 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	DTYMK	P23919	212 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	LPAR6	P43657	344 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	AKR1C2	P52895	323 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	LINC00315	P59091	139 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	AKR1C1	Q04828	323 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		3.4	□□□□□ -1.87

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