RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 PALMDQ9NP74 551 aa12.97□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 S4R3C0 116 aa12.97□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOLR2P14207 255 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR183P32249 361 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKR1C2P52895 323 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRCDQ00LT1 54 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPSB3Q6PJ21 355 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLET1Q6UQ28 207 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 MARCH1Q8TCQ1 289 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 MARC2Q969Z3 335 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRRT1Q99946 306 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEPT1Q9Y6K0 416 aa12.96□□□□□ -0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 DBX1A6NMT0 343 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 UCP1P25874 307 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNFSF8P32971 234 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELLP55199 621 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEFB114Q30KQ6 69 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF114Q8NC26 417 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR4C16Q8NGL9 310 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOSTQ9BQB4 213 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa12.95□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF320A2RRD8 509 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 FABP12A6NFH5 140 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TGOLN2O43493 480 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGKV1-5P01602 117 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 P0C879 139 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CBLN1P23435 193 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 MFAP2P55001 183 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM16LQ309B1 348 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SBSPONQ8IVN8 264 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2C3Q8N628 320 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASCL2Q99929 193 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHA3Q9HB20 300 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 C19orf73Q9NVV2 129 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC2A8Q9NY64 477 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 C21orf62Q9NYP8 219 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 UFC1Q9Y3C8 167 aa12.94□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM213A2RRL7 107 aa12.93□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 IZUMO1RA6ND01 250 aa12.93□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 INS-IGF2F8WCM5 200 aa12.93□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 K7EIM0 57 aa12.93□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERHP84090 104 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAAP20Q6NZ36 180 aa12.93□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM219AQ8IW50 185 aa12.93□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCARB1Q8WTV0 552 aa12.93□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM222Q9H0R3 208 aa12.93□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa12.93□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC160A6NGH7 325 aa12.92□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2T8A6NH00 312 aa12.92□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHODHQ02127 395 aa12.92□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCGB3A2Q96PL1 93 aa12.92□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TXN2Q99757 166 aa12.92□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDCD10Q9BUL8 212 aa12.92□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAA60Q9H7X0 242 aa12.92□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZMAT4Q9H898 229 aa12.92□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR132Q9UNW8 380 aa12.92□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0B4J293 547 aa12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDUFA4O00483 81 aa12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDS2O95674 445 aa12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 C8orf88P0DMB2 117 aa12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SP6Q3SY56 376 aa12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC35G3Q8N808 338 aa12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 UXS1Q8NBZ7 420 aa12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR51S1Q8NGJ8 323 aa12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM190Q8WZ59 177 aa12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 C5orf66Q9H5L9 145 aa12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAV25A0A0B4J276 109 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF785A8K8V0 405 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFNA17P01571 189 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR5AC1P0C628 307 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 S100A5P33763 92 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAUP35544 74 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNCAP37840 140 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 AP3S2P59780 193 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 GLYATL2Q8WU03 294 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEDD2Q8WXF8 326 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 MISP3Q96FF7 219 aa12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TUBA4BQ9H853 241 aa12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms