RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 HRASP01112 189 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV2-5P01817 119 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 HBE1P02100 147 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 C4orf17Q53FE4 359 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 KHDC3LQ587J8 217 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 HARBI1Q96MB7 349 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 NABP2Q9BQ15 211 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRORYQ9H606 182 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 DLL1O00548 723 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 RTL8BQ17RB0 113 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 NECAP1Q8NC96 275 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IFITM10A6NMD0 228 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDUFS7O75251 213 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRGC2P03986 189 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 RD3LP0DJH9 198 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 NPY1RP25929 384 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CNTFRP26992 372 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDUFA6P56556 154 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD81P60033 236 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 POU2AF1Q16633 256 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CGB1A6NKQ9 187 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 KBTBD11O94819 623 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3-48P01763 117 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 COX7A1P24310 79 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q5PR19 223 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF709Q8N972 641 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 APELAP0DMC3 54 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5T1Q8NG75 326 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 C19orf84I3L1E1 186 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 AP4M1O00189 453 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGLV2-23P01705 113 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 PF4V1P10720 104 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGFBP2P18065 325 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 LGALS4P56470 323 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRCDQ00LT1 54 aa8.21□□□□□ -1.09
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CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 C22orf46C9J442 243 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 PAGE4O60829 102 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 APOA2P02652 100 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 REG1AP05451 166 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 GNLYP22749 145 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2G2P60604 165 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADIRFQ15847 76 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR9G1Q8NH87 305 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 ENY2Q9NPA8 101 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRNDQ9UKY0 176 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.21□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDKN1AP38936 164 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM177Q53S58 311 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 MALSU1Q96EH3 234 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 DOK5Q9P104 306 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 VAX2Q9UIW0 290 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACACBO00763 2458 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIST1H2BKO60814 126 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIST1H2BJP06899 126 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIST1H2BOP23527 126 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIST1H2BBP33778 126 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIST1H2BDP58876 126 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIST1H2BCP62807 126 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-210ENST00000566882 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
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