RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 ABCA12Q86UK0 2595 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 C2orf70A6NJV1 201 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 IQCF5A8MTL0 148 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 HYPMO75409 117 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 TPM1P09493 284 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 FAM228BP0C875 321 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 BRS3P32247 399 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 PDE6HQ13956 83 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 KCNJ8Q15842 424 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 SPINK9Q5DT21 86 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 GDF5OSQ5U4N7 250 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 OR5B17Q8NGF7 314 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM19Q96E16 107 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 CISHQ9NSE2 258 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 FUT9Q9Y231 359 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 PXMP4Q9Y6I8 212 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 SPTBP11277 2137 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.08□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 PEAK1Q9H792 1746 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 GGT3PA6NGU5 568 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 OR2T8A6NH00 312 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 FABP5P3A8MUU1 101 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 BIRC5O15392 142 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 FADS1O60427 444 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 HPGDSO60760 199 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 OR5F1O95221 314 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 UGT2B7P16662 529 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 HOXA6P31267 233 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 CLEC6AQ6EIG7 209 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 C5orf46Q6UWT4 87 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 LCA10Q71F78 164 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 AAED1Q7RTV5 226 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 OOSP2Q86WS3 158 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 GKN2Q86XP6 184 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 WFDC11Q8NEX6 87 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 OR11H6Q8NGC7 330 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 IL36BQ9NZH7 164 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 CFAP45Q9UL16 551 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 KIF13BQ9NQT8 1826 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 TTC28Q96AY4 2481 aa-0.09□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 F8P00451 2351 aa-0.1□□□□□ -2.42
FAM227B-211ENST00000560557 E9PCH4 1651 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MUC4Q99102 2169 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FABP12A6NFH5 140 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DISC1C4P0D8 188 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 F5H768 121 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PRM2P04554 102 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MIFP14174 115 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MAP3K7CLP57077 242 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 RAB4BP61018 213 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CCL20P78556 96 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 GRINAQ7Z429 371 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB128Q7Z7B8 93 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00311Q8N616 119 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PFN4Q8NHR9 129 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DNAJB3Q8WWF6 145 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM106AQ96A25 262 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ROPN1LQ96C74 230 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 OPTNQ96CV9 577 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DHRS9Q9BPW9 319 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 NDEL1Q9GZM8 345 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DKKL1Q9UK85 242 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 POLR1DQ9Y2S0 133 aa-0.1□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FREM3P0C091 2139 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 POLQO75417 2590 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 A0A0D9SG42 100 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 OR1I1O60431 355 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DNAL4O96015 105 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 HTR1AP08908 422 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ASAH2BP0C7U1 165 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 EFNA4P52798 201 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FXYD6P3P58550 94 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PPP1R1AQ13522 171 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MPV17LQ2QL34 196 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 Q6ZS92 163 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 Q8N402 240 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 OR4D11Q8NGI4 311 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 C4orf3Q8WVX3 66 aa-0.11□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 RASSF5Q8WWW0 418 aa-0.11□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms