RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV1-5P01602 117 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 CT45A6P0DMU7 189 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 CT45A5P0DMU8 189 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 CT45A7P0DMV0 189 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 PSMB8P28062 276 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 LPAR6P43657 344 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 GNG10P50151 68 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 OR2F1Q13607 317 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 RAB32Q13637 225 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 SMCO1Q147U7 214 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 MOB3BQ86TA1 216 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF383Q8NA42 475 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ARPC1AQ92747 370 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 GPR146Q96CH1 333 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 RNF126Q9BV68 326 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0D9SG52 128 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PPI3 338 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 MARCH11A6NNE9 402 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 LINC01619G3V211 115 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 H0YIZ8 118 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 I3L521 148 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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SMAD3-215ENST00000560424 NQO2P16083 231 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 CNTFRP26992 372 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 MC5RP33032 325 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 AKR1C2P52895 323 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 SLURP1P55000 103 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 GNB1P62873 340 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 RUNX1Q01196 453 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 RTL8BQ17RB0 113 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ACSM6Q6P461 480 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF546Q86UE3 836 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 PDPNQ86YL7 162 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 AQP10Q96PS8 301 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 RNF5Q99942 180 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 NABP2Q9BQ15 211 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 GNB4Q9HAV0 340 aa7.15□□□□□ -1.26
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SMAD3-215ENST00000560424 E5RGE8 158 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 H0YJW9 148 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 K7EPK0 472 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 FCGR3BO75015 233 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 S1PR2O95136 353 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 HRASP01112 189 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-7P01780 117 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 APOA2P02652 100 aa7.14□□□□□ -1.27
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SMAD3-215ENST00000560424 P2RY1P47900 373 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TAS2R30P59541 319 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM177Q53S58 311 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZRM9 215 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 Q8N9W7 124 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 OR52E5Q8NH55 327 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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SMAD3-215ENST00000560424 RETNQ9HD89 108 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 MBD2Q9UBB5 411 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 NSG2Q9Y328 171 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 HSPB11Q9Y547 144 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 CXorf65A6NEN9 183 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 L7N2F9 121 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 ARPC5O15511 151 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 KRASP01116 189 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 CXCL2P19875 107 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 S100A11P31949 105 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 LGALS7P47929 136 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 ERVK-16P61578 105 aa7.13□□□□□ -1.27
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