RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552267.1

LRIG3-208, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3, human

TSL 4

Gene LRIG3, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRIG3-208	ENST00000552267	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	AKR1C1	Q04828	323 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267		Q8NAQ8	132 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	AICDA	Q9GZX7	198 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	SIPA1L1	O43166	1804 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267		A0A1B0GU33	70 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	LEPROT	O15243	131 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	PIAS1	O75925	651 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	PPBP	P02775	128 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	LPAR6	P43657	344 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	PSMD8	P48556	350 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	AP1S1	P61966	158 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	HTR4	Q13639	388 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	NUP35	Q8NFH5	326 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	ZNF675	Q8TD23	568 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LRIG3-208	ENST00000552267	COLCA2	A8K830	154 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	C17orf98	A8MV24	154 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	GGTLC3	B5MD39	225 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	ARPC5	O15511	151 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	BANF1	O75531	89 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	SOD1	P00441	154 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	COL8A2	P25067	703 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	CASP1	P29466	404 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	TPI1	P60174	286 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	ZNF117	Q03924	483 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	LCA10	Q71F78	164 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	CCDC32	Q9BV29	185 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	ARHGEF10	O15013	1369 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267		K7EM74	188 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	CDS2	O95674	445 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	CD24	P25063	80 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	XCL1	P47992	114 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	KRTAP10-8	P60410	259 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	MIA	Q16674	131 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	ARAP1	Q96P48	1450 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	SLIT3	O75094	1523 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	IRGM	A1A4Y4	181 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	TXNDC9	O14530	226 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	OR10J4	P0C629	311 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	CCL5	P13501	91 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	SRI	P30626	198 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	CA5A	P35218	305 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	LINC00315	P59091	139 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	CDC42	P60953	191 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	LTC4S	Q16873	150 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	LYPD6	Q86Y78	171 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	BORCS5	Q969J3	196 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LRIG3-208	ENST00000552267	DUSP21	Q9H596	190 aa		2.75	□□□□□ -1.97

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