RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ADCYAP1P18509 176 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 CDK5R1Q15078 307 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 C3AR1Q16581 482 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FAM27BQ5VT28 67 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PIP4P1Q86T03 277 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf111Q8N326 155 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM204Q9BSN7 226 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TRIP11Q15643 1979 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PPI3 338 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 IGLC1P0CG04 106 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 CA6P23280 308 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TSPO2Q5TGU0 170 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 MDP1Q86V88 176 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB125Q8N687 156 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PRORYQ9H606 182 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 CHD5Q8TDI0 1954 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 CREBBPQ92793 2442 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SIPA1L1O43166 1804 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 K7EN84 100 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 RAMP1O60894 148 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ACTL10Q5JWF8 245 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 IMMP1LQ96LU5 166 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 DERL3Q96Q80 235 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.34□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TIAF1O95411 115 aa5.34□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CTSBP07858 339 aa5.34□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CT62P0C5K7 136 aa5.34□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CA7P43166 264 aa5.34□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FOXL1Q12952 345 aa5.34□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35E4Q6ICL7 350 aa5.34□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.34□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SPTA1P02549 2419 aa5.34□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TRPM6Q9BX84 2022 aa5.34□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 BCL3P20749 454 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 COX7A1P24310 79 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 EGR4Q05215 589 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CACNG5Q9UF02 275 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FZR1Q9UM11 496 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 F8VVB4 439 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 F8VWA3 439 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 H2BFSP57053 126 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZS92 163 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 APCDD1LQ8NCL9 501 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SOSTQ9BQB4 213 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PRO0628Q9UI54 55 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ZG16O60844 167 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 KBTBD11O94819 623 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GUS0 222 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 GGTLC3B5MD39 225 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 MGST3O14880 152 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 PRTN3P24158 256 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 ATP5G3P48201 142 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 OR1L1Q8NH94 360 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 BGLAPP02818 100 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ARPC1AQ92747 370 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 EPDR1Q9UM22 224 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf94C9JXX5 98 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 H7C1H1 209 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS1P07477 247 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 GATA3P23771 443 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 NPC2P61916 151 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 IGFL3Q6UXB1 125 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R4Q9NYW5 299 aa5.32□□□□□ -1.56
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