RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 ZNF773Q6PK81 442 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 Q6ZRM9 215 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TMEM203Q969S6 136 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TXN2Q99757 166 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TMEM140Q9NV12 185 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 X6R8D5 127 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 HSPG2P98160 4391 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 K7EIM0 57 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 CD74P04233 296 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 ERVK-16P61578 105 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 WT1-ASQ06250 92 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 C12orf74Q32Q52 190 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 RNF212Q495C1 297 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 Q8N1X5 172 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 COMMD9Q9P000 198 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 PKD1P98161 4303 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 TNFSF12O43508 249 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 MFAP4P55083 255 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 TMEM56Q96MV1 263 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 VSIRQ9H7M9 311 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 RABAC1Q9UI14 185 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 CELA1Q9UNI1 258 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 SCGNO76038 276 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 RCN1Q15293 331 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 CDNFQ49AH0 187 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 HACD4Q5VWC8 232 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 OR1P1Q8NH06 330 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 BORCS5Q969J3 196 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 HINT2Q9BX68 163 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 ATG5Q9H1Y0 275 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 A0A1W2PS18 150 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 TMEM189A5PLL7 270 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 SULT1C2O00338 296 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 GNG7O60262 68 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 SNAPC5O75971 98 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 C4BPBP20851 252 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 GNG2P59768 71 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 ST8SIA2Q92186 375 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 IFITM5A6NNB3 132 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 MARCH11A6NNE9 402 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 HSMCR30P0CW71 290 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 CADM3Q8N126 398 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 GPHA2Q96T91 129 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 SCN3BQ9NY72 215 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 PRNDQ9UKY0 176 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 PTGES3LE9PB15 166 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 PPYP01298 95 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 MYL9P24844 172 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-228ENST00000551473 FCGR2CP31995 323 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms