RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 GINS3Q9BRX5 216 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 ARV1Q9H2C2 271 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 SMCO3A2RU48 225 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 A6NDX4 124 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 AREGP15514 252 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 DLK1P80370 383 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 BSXQ3C1V8 233 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 SPNS3Q6ZMD2 512 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 TMED6Q8WW62 240 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 P2RX4Q99571 388 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 HLA-DRB1P01911 266 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ATP6V0CP27449 155 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 RAB14P61106 215 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 IL17RELQ6ZVW7 336 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 GGACTQ9BVM4 153 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 BTBD17A6NE02 478 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 PRSS46E5RG02 174 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 FGF16O43320 207 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 SEC11BP0C7V7 166 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 PARP11Q9NR21 331 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 TNCP24821 2201 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 PDZD2O15018 2839 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 SPP1P10451 314 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 FGF7P21781 194 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 NDPQ00604 133 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 RUNX1Q01196 453 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 VWC2Q2TAL6 325 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF114Q8NC26 417 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 MISP3Q96FF7 219 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV4-59P01825 116 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 AKR1C1Q04828 323 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 CD69Q07108 199 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 OR1P1Q8NH06 330 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 OR5R1Q8NH85 324 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 RSG1Q9BU20 258 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 VPS13CQ709C8 3753 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 M0QZK8 103 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 DEFA4P12838 97 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 CTRB1P17538 263 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 HNF1AP20823 631 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 OPRK1P41145 380 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 IER3P46695 156 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 CLLU1Q5K131 121 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 BTNL8Q6UX41 500 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 Q6YL49 198 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 SLC16A13Q7RTY0 426 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 RNF141Q8WVD5 230 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 SLC35E1Q96K37 410 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 RFNGQ9Y644 331 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 FNDC10F2Z333 226 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 CORTO00230 105 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ATP6V0E1O15342 81 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 SULT1A2P50226 295 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 MFAP2P55001 183 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 MLANAQ16655 118 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-209ENST00000549308 ECSCRQ19T08 205 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms