RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 PRTN3P24158 256 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 KIR2DL5AQ8N109 375 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 RPEQ96AT9 228 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 BRWD1Q9NSI6 2320 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM14DPA8MWL7 114 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 H0YIZ8 118 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 GAPTQ8N292 157 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 IL36GQ9NZH8 169 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 EDDM3AQ14507 147 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-214ENST00000540109 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 EFNA2O43921 213 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 IL18BPO95998 194 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 PRSS12P56730 875 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-214ENST00000540109 MRGPRFQ96AM1 343 aa5.11□□□□□ -1.59
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