RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	ASB13	Q8WXK3	278 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730		U3KQ87	197 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730		A0A0G2JRQ6	117 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PITX3	O75364	302 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	ADAP1	O75689	374 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TRGV3	P03979	118 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	RAB9A	P51151	201 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CD83	Q01151	205 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PRR31	Q5SQ13	230 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730		Q6ZRM9	215 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	OR2C3	Q8N628	320 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF114	Q8NC26	417 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CXorf58	Q96LI9	332 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	C2orf50	Q96LR7	162 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	MED28	Q9H204	178 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	HMX3	A6NHT5	357 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SCGB2A1	O75556	95 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	PET100	P0DJ07	73 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SPN	P16150	400 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	TPPP2	P59282	170 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RAB40C	Q96S21	281 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	CITED1	Q99966	193 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SYNGR2	O43760	224 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RLN2	P04090	185 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RAB11A	P62491	216 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	KLK9	Q2XQG4	91 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	DTD1	Q8TEA8	209 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ATP6V0B	Q99437	205 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ALG5	Q9Y673	324 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730		M0QZ24	198 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	GOSR2	O14653	212 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	AREG	P15514	252 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	TAS2R30	P59541	319 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ID3	Q02535	119 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	NMES1	Q9C002	83 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	CGB1	A6NKQ9	187 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	NUDT19	A8MXV4	375 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730		E7EUB6	86 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730		L7N2F9	121 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	IFNA10	P01566	189 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	APELA	P0DMC3	54 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	MYOD1	P15172	320 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	VAMP2	P63027	116 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RHOG	P84095	191 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RBKS	Q9H477	322 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SOX15	O60248	233 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	SCGB1D2	O95969	90 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	CD28	P10747	220 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	NPY1R	P25929	384 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	C2orf83	Q53S99	150 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	OR10C1	Q96KK4	312 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	MS4A10	Q96PG2	267 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1B0GW64	132 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	REG1A	P05451	166 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-224	ENST00000534730	RUNX1	Q01196	453 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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