RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 YPEL1O60688 119 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 JTBO76095 146 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 APOMO95445 188 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MT-ATP8P03928 68 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CECR9P0C854 216 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CA7P43166 264 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CRISP3P54108 245 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HERV-K104P61576 105 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CENPWQ5EE01 88 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM182AQ5T1J6 154 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OTOSQ8NHW6 89 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NEURL3Q96EH8 262 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 YPEL2Q96QA6 119 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IMUPQ9GZP8 106 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AICDAQ9GZX7 198 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NAA60Q9H7X0 242 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ST20Q9HBF5 79 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM100Q9NV29 134 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AK3Q9UIJ7 227 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PCTPQ9UKL6 214 aa5.65□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C5P01031 1676 aa5.65□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CITO14578 2027 aa5.65□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PKD1L3Q7Z443 1732 aa5.65□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRC1P22897 1456 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VWA8A3KMH1 1905 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TCHHQ07283 1943 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NHSL1Q5SYE7 1610 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAV27A0A087WT01 109 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SMIM22K7EJ46 135 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANGPTL7O43827 346 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NDUFS7O75251 213 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HYPMO75409 117 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PNOCQ13519 176 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MSRB3Q8IXL7 192 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR51H1Q8NH63 302 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAL2Q969L2 176 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBR2Q8IWV8 1755 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARID2Q68CP9 1835 aa5.64□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H3BRM9 83 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAX4O43316 350 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GYPAP02724 150 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H2AFZP0C0S5 128 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLK7P49862 253 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GFERP55789 205 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CST6Q15828 149 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HES3Q5TGS1 186 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VN1R4Q7Z5H5 301 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MUCL1Q96DR8 90 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RITA1Q96K30 269 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OTORQ9NRC9 128 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RABAC1Q9UI14 185 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CROCCQ5TZA2 2017 aa5.63□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EPM2AB3EWF7 344 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 M0R2P5 195 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TYROBPO43914 113 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PITX3O75364 302 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NDUFB6O95139 128 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CRYGAP11844 174 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC25A6P12236 298 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPL34P49207 117 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLEC20AQ6ZU45 233 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms