RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 CYB5BO43169 146 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 ANXA3P12429 323 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 CCR6P51684 374 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 THYN1Q9P016 225 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 CENPXA8MT69 81 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 ST8SIA3O43173 380 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 OR2C3Q8N628 320 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC35G3Q8N808 338 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 S100ZQ8WXG8 99 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 CXorf58Q96LI9 332 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC140Q96MF4 163 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 PRR13Q9NZ81 148 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 SORL1Q92673 2214 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 MFSD2BA6NFX1 497 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 BMPR1BO00238 502 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 NDUFB6O95139 128 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 MFAP2P55001 183 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SRPXP78539 464 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 RPEL1Q2QD12 228 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ACSM6Q6P461 480 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 Q6ZRM9 215 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 REC114Q7Z4M0 266 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF114Q8NC26 417 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC32Q9BV29 185 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 S4R3C0 116 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A0B4J2A0 478 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 IFNA17P01571 189 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 IGHV3-23P01764 117 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 BTCP35070 178 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 INSL3P51460 131 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 KRTAP10-11P60412 298 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 AARDQ4LEZ3 155 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SPINK9Q5DT21 86 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 LGI3Q8N145 548 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 OR1P1Q8NH06 330 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR146Q96CH1 333 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 CACNG5Q9UF02 275 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP5D1E7EU14 171 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 VAMP1P23763 118 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 CLEC19AQ6UXS0 136 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 PLA2G10O15496 165 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SAP30O75446 220 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SYNJ2BPP57105 145 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R1AQ13522 171 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 NMSQ5H8A3 153 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 OR52E5Q8NH55 327 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF502Q8TBZ5 544 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 LYRM1O43325 122 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SFT2D2O95562 160 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ARL3P36405 182 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SPCS3P61009 180 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 TATDN3Q17R31 274 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 LRTM2Q8N967 370 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 K7EIM0 57 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 OR4C12Q96R67 309 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 ENY2Q9NPA8 101 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-208ENST00000531226 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CLEC3BP05452 202 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR183P32249 361 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SNCAP37840 140 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SCARB1Q8WTV0 552 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MISP3Q96FF7 219 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP6V0BQ99437 205 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 C21orf62Q9NYP8 219 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CACFD1Q9UGQ2 172 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.51□□□□□ -0.09
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