RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530483.1

TTC17-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 2

Gene TTC17, Length 456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-211ENST00000530483 DHRS11Q6UWP2 260 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 IDO2Q6ZQW0 420 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 KCTD9Q7L273 389 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SLC25A42Q86VD7 318 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 MMD2Q8IY49 270 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TTC9CQ8N5M4 171 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 GVQW1Q8N7I0 195 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 OR5AP2Q8NGF4 316 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 ACOT12Q8WYK0 555 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SNAPC3Q92966 411 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SLC25A38Q96DW6 304 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 YIPF6Q96EC8 236 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 OR2A7Q96R45 310 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SPIN2AQ99865 258 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 ASCL2Q99929 193 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TPPP3Q9BW30 176 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 CCL28Q9NRJ3 127 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 COA4Q9NYJ1 87 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa2.56□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 MEIS3P1A6NDR6 274 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 FAM223BA6NKX1 122 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TEX22C9J3V5 150 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 H0Y980 276 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TNFSF12O43508 249 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TNFRSF6BO95407 300 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 HPRT1P00492 218 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 PPYP01298 95 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 PRH1P02810 166 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 FCER2P06734 321 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 ZNF735P0CB33 412 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 APELAP0DMC3 54 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 PTHLHP12272 177 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 GP9P14770 177 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 NQO2P16083 231 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 RAB4AP20338 218 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 GNRHRP30968 328 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 PRSS3P35030 304 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 MAS1LP35410 378 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TGFBR1P36897 503 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 CDKN1BP46527 198 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 RFX2P48378 723 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 RORCP51449 518 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SYNJ2BPP57105 145 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 BRWD1-AS2P59051 145 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TAS2R20P59543 309 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 FXYD4P59646 89 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 RHOGP84095 191 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 OR2B11Q5JQS5 317 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 UBE2NLQ5JXB2 153 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 IL34Q6ZMJ4 242 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 LINC00299Q6ZSB3 139 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SSX9Q7RTT3 188 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SPAG16Q8N0X2 631 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SAMD12Q8N8I0 201 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 NECAP1Q8NC96 275 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 OR9G4Q8NGQ1 327 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 OR13F1Q8NGS4 319 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 OR6F1Q8NGZ6 308 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 OR4S2Q8NH73 311 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 OR4A5Q8NH83 315 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 VSTM2AQ8TAG5 236 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 CD300LFQ8TDQ1 290 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SECTM1Q8WVN6 248 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SLC25A46Q96AG3 418 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 ABHD1Q96SE0 405 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 VCX2Q9H322 139 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 IFT46Q9NQC8 304 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SLC2A9Q9NRM0 540 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TAS2R8Q9NYW2 309 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 COMMD3Q9UBI1 195 aa2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.54□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TRAV3A0A0B4J244 114 aa2.54□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa2.54□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa2.54□□□□□ -2
TTC17-211ENST00000530483 NPIPB5A8MRT5 1133 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms