RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513398.1

ACTN3-203, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN3, Length 2,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-203ENST00000513398 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 TPRX1Q8N7U7 411 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 RNF114Q9Y508 228 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 CCL21O00585 134 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 GCHFRP30047 84 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 RPEL1Q2QD12 228 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 SMPD2O60906 423 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 PRB1P04280 392 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 MMD2Q8IY49 270 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 COQ2Q96H96 371 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 UQCRFS1P47985 274 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 Q0VG73 95 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 LTC4SQ16873 150 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 DIRC3C9JPN6 131 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 FCGR3BO75015 233 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 HTD2P86397 168 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 OR4A16Q8NH70 328 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 GNB4Q9HAV0 340 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN3-203ENST00000513398 SPINK4O60575 86 aa14.71□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 UHRF2Q96PU4 802 aa14.71□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 COL8A2P25067 703 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 RAB7AP51149 207 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 MSMPQ1L6U9 139 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 PRORYQ9H606 182 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 Q6ZR03 302 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 RND1Q92730 232 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 RNF2Q99496 336 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 MED13LQ71F56 2210 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 SIAH2O43255 324 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 GPX1P07203 203 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 AMTP48728 403 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 PMCHP20382 165 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 CHRNB4P30926 498 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 SPATA45Q537H7 98 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 LINC01560Q8TB33 94 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 LRRK2Q5S007 2527 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 C9JCJ5 164 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 MT-CO2P00403 227 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 GPR12P47775 334 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 RBPJQ06330 500 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 MMDQ15546 238 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 C11orf52Q96A22 123 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 HES4Q9HCC6 221 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 V9GYV3 84 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 TCF21O43680 179 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 IGKV3-15P01624 115 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 RHOBP62745 196 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 EFNB3Q15768 340 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 Q8N976 141 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 NRN1Q9NPD7 142 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 VPS13CQ709C8 3753 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 HCFC1P51610 2035 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 PRSS46E5RG02 174 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 FOXH1O75593 365 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 METRNQ9UJH8 293 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms