RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 WT1-ASQ06250 92 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 SPINK9Q5DT21 86 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 OR2C3Q8N628 320 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 RNF152Q8N8N0 203 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 USMG5Q96IX5 58 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 PLXNB1O43157 2135 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 TNCP24821 2201 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 A0A1B0GW64 132 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 C7orf66A4D0T2 115 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 CGB1A6NKQ9 187 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 M0QZ24 198 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 GOSR2O14653 212 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 SOX15O60248 233 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 PITX3O75364 302 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 SCGB1D2O95969 90 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 HTR2BP41595 481 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 ATP5G2Q06055 141 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 FAM209BQ5JX69 171 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 NECAP1Q8NC96 275 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 OR1P1Q8NH06 330 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 DTD1Q8TEA8 209 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 C2orf50Q96LR7 162 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 RBKSQ9H477 322 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 ALG5Q9Y673 324 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 U3KQ87 197 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 A0A1W2PRX2 142 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 CORTO00230 105 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 CCSO14618 274 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 SYNGR2O43760 224 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 OR2J3O76001 311 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 IFNA10P01566 189 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 KRTAP10-3P60369 221 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 RHOGP84095 191 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF114Q8NC26 417 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 OR10C1Q96KK4 312 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 CXorf58Q96LI9 332 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 OR4F4Q96R69 305 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 MED28Q9H204 178 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 KLK15Q9H2R5 256 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 ANK2Q01484 3957 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 MPTX1A8MV57 137 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 L7N2F9 121 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 PRH1P02810 166 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 RAB11AP62491 216 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 VAMP2P63027 116 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 C15orf32Q32M92 178 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 P2RX4Q99571 388 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 SSSCA1O60232 199 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 SCGB2A1O75556 95 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 RLN2P04090 185 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 IAPPP10997 89 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 NPY1RP25929 384 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 ID3Q02535 119 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 MISP3Q96FF7 219 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 RAB40CQ96S21 281 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 NMES1Q9C002 83 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 IGHV3-11P01762 117 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 PF4P02776 101 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 IFNA4P05014 189 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGA3-210ENST00000507771 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms