RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 SYNGR1O43759 233 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 P04436 131 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 RAC3P60763 192 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 GJC3Q8NFK1 279 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 RNF183Q96D59 192 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 AP1S3Q96PC3 154 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 PSMB11A5LHX3 300 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 C21orf140B9A014 251 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 H3BRM9 83 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ISLRO14498 428 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 GPM6AP51674 278 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 PSG3Q16557 428 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TREML4Q6UXN2 200 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 OOSP2Q86WS3 158 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 DRAM1Q8N682 238 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 NUP35Q8NFH5 326 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ARPC1AQ92747 370 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF479Q96JC4 524 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PRE2 83 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 C5orf49A4QMS7 147 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 LRRC30A6NM36 301 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 SCGB1A1P11684 91 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 CCL2P13500 99 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 GFERP55789 205 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 HERV-K104P63124 156 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZSR3 168 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 DDB2Q92466 427 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 FAM186AA6NE01 2351 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 C17orf98A8MV24 154 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 LEPROTL1O95214 131 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 COX8AP10176 69 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 CRYGSP22914 178 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 FXYD7P58549 80 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 GUSBP1Q15486 140 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ETDBQ3ZM63 59 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 OR2V2Q96R30 315 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 C20orf78Q9BR46 151 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 C1RLQ9NZP8 487 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 PSG8Q9UQ74 426 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 GGTLC3B5MD39 225 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 CHEK1O14757 476 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TNFSF11O14788 317 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 HBZP02008 142 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 CSN3P07498 182 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF137PP52743 207 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 HHEXQ03014 270 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 EFNB3Q15768 340 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM42Q69YG0 159 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 C10orf35Q96D05 121 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 SVILO95425 2214 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 DOCK7Q96N67 2140 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 PRR33A8MZF0 331 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 C9JCJ5 164 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 CXorf1O96002 111 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 FAM106CPP0CH98 169 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 AESQ08117 197 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 FHL3Q13643 280 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 LTC4SQ16873 150 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 AMTNQ6UX39 209 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZS52 159 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.04□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF503Q96F45 646 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms