RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 SS18L2Q9UHA2 77 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXL7Q9UJT9 491 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR132Q9UNW8 380 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SRRM5B3KS81 715 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB29O14966 203 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SPRY3O43610 288 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF253O75346 499 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SSTR5P35346 364 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF266Q14584 549 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 C12orf54Q6X4T0 127 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM230Q96A57 120 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SPATA25Q9BR10 227 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 CADP27708 2225 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 IGSF23A1L1A6 192 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 BCL2P10415 239 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ARFRP1Q13795 201 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ADIRFQ15847 76 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6P435 159 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 NECAP1Q8NC96 275 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC29Q8WV35 223 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF488Q96MN9 340 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 DYNLRB1Q9NP97 96 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 THYN1Q9P016 225 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 DYSFO75923 2080 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 HS3ST1O14792 307 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SH2D1BO14796 132 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PLAUP00749 431 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 LHBP01229 141 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 CD33P20138 364 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 AADACP22760 399 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR12P47775 334 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTDAPP60985 99 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 RUNX1Q01196 453 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 Q0VG73 95 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 NEUROG1Q92886 237 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF7Q9UBF6 113 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 A4D1N5 150 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM189A5PLL7 270 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 C19orf84I3L1E1 186 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 J3QR89 54 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC17A3O00476 420 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 DEGS1O15121 323 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 IFNA1P01562 189 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZS49 121 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF826PQ6ZT77 177 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 DTX2Q86UW9 622 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 MOGAT3Q86VF5 341 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GCM1Q9NP62 436 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 EHFQ9NZC4 300 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PLCE1Q9P212 2302 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMB11A5LHX3 300 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC30A6NM36 301 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 K7EP34 96 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SIVA1O15304 175 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SERF1AO75920 110 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2H2O95918 312 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 IL3RAP26951 378 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP6V0CP27449 155 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 HRH1P35367 487 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00310P59036 64 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R46P59540 309 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE5Q13069 117 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE6Q13070 117 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 STUMQ69YW2 141 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ERASQ7Z444 233 aa5.97□□□□□ -1.45
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