RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM86BQ8N661 226 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 DCANP1Q8TF63 244 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 PZPP20742 1482 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 J3QQQ9 107 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 CDKN2CP42773 168 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 TPI1P60174 286 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 RPL26P61254 145 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 RELAQ04206 551 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 HES1Q14469 280 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 OR51T1Q8NGJ9 327 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 VPS29Q9UBQ0 182 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 NSA2O95478 260 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 RPS17P08708 135 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 S100A7P31151 101 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 PSME3P61289 254 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB103AP81534 67 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 IFITM2Q01629 132 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.899e-6■■■■■ 50.1
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A6Q92536 515 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 IMMP2LQ96T52 175 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 NLRP1Q9C000 1473 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF532Q9HCE3 1301 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 I3L521 148 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 LYPLA2O95372 231 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM258P61165 79 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 GLO1Q04760 184 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 GRK1Q15835 563 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 ALKAL1Q6UXT8 129 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 OR1L8Q8NGR8 309 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 NCOA2Q15596 1464 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 KCPQ6ZWJ8 1503 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 RFPL4AA6NLU0 287 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 FGF6P10767 208 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 IFI30P13284 250 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 SPOPLQ6IQ16 392 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD7Q92527 254 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 PREX2Q70Z35 1606 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 PXDNLA1KZ92 1463 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN24A6NM45 220 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 LEPROTO15243 131 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 PSMD8P48556 350 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 RAB14P61106 215 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf64Q5T6V5 341 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN22Q8N7P3 220 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 OR51V1Q9H2C8 321 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 FUT9Q9Y231 359 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 MIA2Q96PC5 1412 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 MSMBP08118 114 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 MSNP26038 577 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 DOHHQ9BU89 302 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 MYOM2P54296 1465 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 NCKAP5O14513 1909 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf71Q711Q0 1435 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA3Q08378 1498 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 MLH3Q9UHC1 1453 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 H3BT86 120 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 H7C2G1 150 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 OVOL1O14753 267 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 CHP2O43745 196 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 C1QAP02745 245 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1-16P04430 117 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 AESQ08117 197 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 GUK1Q16774 197 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-212ENST00000491302 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
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