RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	RHOG	P84095	191 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	BSX	Q3C1V8	233 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	OR1P1	Q8NH06	330 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	NUDT15	Q9NV35	164 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	CACNG5	Q9UF02	275 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1B0GU03	582 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	OR13C7	P0DN81	318 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	SPCS3	P61009	180 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	SMCO1	Q147U7	214 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	MITD1	Q8WV92	249 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	ATP6V0B	Q99437	205 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	PF4	P02776	101 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	PRH1	P02810	166 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	REG1A	P05451	166 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	OR8U8	P0C7N1	319 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	MFAP2	P55001	183 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF616	Q08AN1	781 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFB136	Q30KP8	78 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	C15orf32	Q32M92	178 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	OR11H1	Q8NG94	326 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	CYB5B	O43169	146 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	WIPF1	O43516	503 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB25	P57735	213 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	COQ8A	Q8NI60	647 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	PALMD	Q9NP74	551 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	THYN1	Q9P016	225 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC01619	G3V211	115 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	OR2J3	O76001	311 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-11	P01762	117 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	IL5	P05113	134 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFA1	P59665	94 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFA3	P59666	94 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	ATP5G2	Q06055	141 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	C4orf46	Q504U0	113 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	ENKUR	Q8TC29	256 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	CXorf58	Q96LI9	332 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	CCDC140	Q96MF4	163 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	HINT2	Q9BX68	163 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A087WW49	117 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	NDUFB8	O95169	186 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	IFNA17	P01571	189 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFA4	P12838	97 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFA5	Q01523	94 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	TNFRSF9	Q07011	255 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290		K7EIM0	57 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	ZP3	P21754	424 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	DUX3	Q96PT4	197 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	OR5B12	Q96R08	314 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290		F8W735	103 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290		I3L2K1	104 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	CORT	O00230	105 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	BMPR1B	O00238	502 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	PRAF2	O60831	178 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	PTTG1	O95997	202 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV12-3	P01733	135 aa		12.72	□□□□□ -0.37

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