RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485939.5

BBX-225, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 4

Gene BBX, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-225	ENST00000485939	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	DBX1	A6NMT0	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	SULT1C2	O00338	296 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	NDUFA4	O00483	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	UPK2	O00526	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	SSX5	O60225	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	AMBP	P02760	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	CTSG	P08311	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	TCTA	P57738	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	FABP5	Q01469	135 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939		Q6ZRM9	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	DFFB	O76075	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	YIF1A	O95070	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	DIRAS3	O95661	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	DHFR	P00374	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	CD36	P16671	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	RAB6A	P20340	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	MAS1L	P35410	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	MAP2K4	P45985	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	DEFB1	P60022	68 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	IRF3	Q14653	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	SPHAR	Q15513	63 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939		Q56UQ5	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939		V9GY05	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939		A0A087WWL8	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939		K7EMT4	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	CD74	P04233	296 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	SERPINE2	P07093	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	TALDO1	P37837	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	RASSF2	P50749	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	FXYD4	P59646	89 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939		Q6ZS49	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	UFD1	Q92890	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	MND1	Q9BWT6	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939		A0A1B0GU03	582 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939		I3L2K1	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	HRAS	P01112	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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