RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483212.1

USP4-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 727 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-210ENST00000483212 ESM1Q9NQ30 184 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 INAFM1C9JVW0 142 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 M0QZK8 103 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 ATP6V0E1O15342 81 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 ACTL6BO94805 426 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 CRYGCP07315 174 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 CTRB1P17538 263 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 CAV2P51636 162 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 BLCAPP62952 87 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 NHLH2Q02577 135 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 KLK9Q2XQG4 91 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 C2orf83Q53S99 150 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 Q6ZS46 218 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 ZNF114Q8NC26 417 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 ARPC1AQ92747 370 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 P2RX4Q99571 388 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 HSPB11Q9Y547 144 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP4-210ENST00000483212 A0A0D9SG52 128 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 CLDN34H7C241 214 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 CST7O76096 145 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 IGHG2P01859 326 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 IGF1P05019 195 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 OR13C7P0DN81 318 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 SRD5A1P18405 259 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 NPY1RP25929 384 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 HTR2BP41595 481 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 SULT1A1P50225 295 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 MFAP2P55001 183 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP4-210ENST00000483212 PRR20BP86481 221 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 PRR20AP86496 221 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 BAXQ07812 192 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 TMUB2Q71RG4 321 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP4-210ENST00000483212 ENY2Q9NPA8 101 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 FBXL17Q9UF56 701 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP4-210ENST00000483212 PLXNB1O43157 2135 aa6.48□□□□□ -1.37
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USP4-210ENST00000483212 CNIH1O95406 144 aa6.48□□□□□ -1.37
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USP4-210ENST00000483212 REG1AP05451 166 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 APELAP0DMC3 54 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 S100A11P31949 105 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 HILS1P60008 231 aa6.48□□□□□ -1.37
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USP4-210ENST00000483212 OPCMLQ14982 345 aa6.48□□□□□ -1.37
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USP4-210ENST00000483212 LFNGQ8NES3 379 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 OR1P1Q8NH06 330 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 DUX5Q96PT3 197 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 ARL6Q9H0F7 186 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 ZNF702PQ9H963 129 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 PARP11Q9NR21 331 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.48□□□□□ -1.37
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USP4-210ENST00000483212 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 G3V318 75 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 SOX15O60248 233 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 CRLF1O75462 422 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 OR8U8P0C7N1 319 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP4-210ENST00000483212 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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