RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 TSC22D2O75157 780 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXO24O75426 580 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 APELAP0DMC3 54 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB11AP62491 216 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 COMMD1Q8N668 190 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF114Q8NC26 417 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5T1Q8NG75 326 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 OR1P1Q8NH06 330 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01006Q8NI28 216 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 THYN1Q9P016 225 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMB11A5LHX3 300 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 CORTO00230 105 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 BRI3O95415 125 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 REG1AP05451 166 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A4P12235 298 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 NPY1RP25929 384 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 P2RY1P47900 373 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 CAV2P51636 162 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXL1Q12952 345 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 BSXQ3C1V8 233 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf83Q53S99 150 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 TEX38Q6PEX7 206 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 P2RX4Q99571 388 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF126Q9BV68 326 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 MBD2Q9UBB5 411 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.37□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 H0YIZ8 118 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 PFDN1O60925 122 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM50AO95807 157 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHG4P01861 327 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 IFNA4P05014 189 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 ELANEP08246 267 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 OR8U8P0C7N1 319 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 LYL1P12980 280 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 PAX9P55771 341 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 CFHR3Q02985 330 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXE3Q13461 319 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 KLK9Q2XQG4 91 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM65Q6PI78 240 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 DCUN1D4Q92564 292 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF114Q9Y508 228 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 C15orf62A8K5M9 175 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BP45 60 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV1-40P01703 118 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 PF4V1P10720 104 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 Q5BKY6 102 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF329Q86UD4 541 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF546Q86UE3 836 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 STX12Q86Y82 276 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SH3BP4-208ENST00000462602 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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