RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PPIAL4GP0DN37 164 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR13C7P0DN81 318 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 DEFA4P12838 97 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 NPPCP23582 126 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RPL29P47914 159 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 LGALS7P47929 136 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 REG1BP48304 166 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RAB13P51153 203 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 MFAP2P55001 183 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 DLX1P56177 255 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RHEBQ15382 184 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS8Q16651 343 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 FBLN7Q53RD9 439 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A24Q6NUK1 477 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 LCN15Q6UWW0 184 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM144Q7Z5S9 345 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35E3Q7Z769 313 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PNKDQ8N490 385 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 Q8N6K4 173 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TEX45Q8NA69 505 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR10W1Q8NGF6 305 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR8B3Q8NGG8 313 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR10G9Q8NGN4 311 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR10X1Q8NGY0 326 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 AJUBAQ96IF1 538 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR8B2Q96RD0 313 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC7AQ9BXN2 247 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A22Q9H936 323 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHA3Q9HB20 300 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 NPVFQ9HCQ7 196 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 VAX2Q9UIW0 290 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 MED13LQ71F56 2210 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 FBN2P35556 2912 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CHD6Q8TD26 2715 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TEX22C9J3V5 150 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM250H0YL14 139 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 H3BQ15 152 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 FAM229AH3BQW9 127 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFS7O75251 213 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFA3O95167 84 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 VENTXO95231 258 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV2-5P01817 119 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 PRTN3P24158 256 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 IL3RAP26951 378 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 EFNA4P52798 201 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 LMO4P61968 165 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 RAB11AP62491 216 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CD69Q07108 199 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 GAMTQ14353 236 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 PSG5Q15238 335 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 C10orf55Q5SWW7 151 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 MIC13Q5XKP0 118 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TEPPQ6URK8 271 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 MOB3BQ86TA1 216 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF843Q8N446 348 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 THAP8Q8NA92 274 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CACNG8Q8WXS5 425 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 MALSU1Q96EH3 234 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CLCC1Q96S66 551 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 RNF5Q99942 180 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SIRPDQ9H106 197 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 MANBALQ9NQG1 85 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SLC39A9Q9NUM3 307 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 GNG13Q9P2W3 67 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 SIGLEC9Q9Y336 463 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 PXMP4Q9Y6I8 212 aa4.52□□□□□ -1.69
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