RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 OR2B8PP59922 312 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 AADACL3Q5VUY0 350 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 OR4D10Q8NGI6 311 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 OR51H1Q8NH63 302 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 ASCL2Q99929 193 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 RSRP1Q9BUV0 290 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 COMMD9Q9P000 198 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 FBXL7Q9UJT9 491 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 FLVCR2Q9UPI3 526 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV3A0A0B4J244 114 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 H0Y980 276 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFB8O95169 186 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 GIPP09681 153 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 RAP2BP61225 183 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF585BQ52M93 769 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 LPCAT3Q6P1A2 487 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 HAPLN4Q86UW8 402 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 SBSPONQ8IVN8 264 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 CMTM1Q8IZ96 169 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 PEMTQ9UBM1 199 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 GPR31O00270 319 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 GGCTO75223 188 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 S1PR2O95136 353 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 UCP3P55916 312 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 TSPAN5P62079 268 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 C4orf46Q504U0 113 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 C19orf35Q6ZS72 473 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 GPHB5Q86YW7 130 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 OR11H7Q8NGC8 314 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 OR13C8Q8NGS7 320 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 TERB2Q8NHR7 220 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 SEC22CQ9BRL7 303 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 COMMD5Q9GZQ3 224 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM140Q9NV12 185 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 C19orf73Q9NVV2 129 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 MGAT4CQ9UBM8 478 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 IGLC7A0M8Q6 106 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 LGALS9O00182 355 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 OR4E1P0C645 316 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 C4BPBP20851 252 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 LPAR6P43657 344 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 DMBX1Q8NFW5 382 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 OR2K2Q8NGT1 345 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 ZFAND1Q8TCF1 268 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC140Q96MF4 163 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 FXYD6Q9H0Q3 95 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf3-210ENST00000462125 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 MARCH11A6NNE9 402 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 PPP5D1E7EU14 171 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 OR2C1O95371 312 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 DEFA4P12838 97 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 TMED4Q7Z7H5 227 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 LYG2Q86SG7 212 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 LHFPL1Q86WI0 220 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 CXorf58Q96LI9 332 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 BIRC6Q9NR09 4857 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 TENM3Q9P273 2699 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 A0A0B4J2A0 478 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 IZUMO1RA6ND01 250 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 KRASP01116 189 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 REG1AP05451 166 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 CLEC3BP05452 202 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 SERPINE2P07093 398 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 ERVK-16P61578 105 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 LCN12Q6JVE5 192 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 CLEC19AQ6UXS0 136 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 OR10W1Q8NGF6 305 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 OR1L8Q8NGR8 309 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 THYN1Q9P016 225 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 C2orf70A6NJV1 201 aa10□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF785A8K8V0 405 aa10□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3-23P01764 117 aa10□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
C9orf3-210ENST00000462125 FOLR2P14207 255 aa10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms