RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 HLA-DQB2P05538 268 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 P0C879 139 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE2AP49459 152 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00313P59037 77 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 NCALDP61601 193 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 AP1S1P61966 158 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 KIAA0040Q15053 153 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00303Q3SY05 128 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 KLHL12Q53G59 568 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 GUSBP11Q6P575 273 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 C15orf40Q8WUR7 153 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 REEP6Q96HR9 211 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 EFCAB11Q9BUY7 163 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 SSR3Q9UNL2 185 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 COQ4Q9Y3A0 265 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 ASB4Q9Y574 426 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 PLIN4Q96Q06 1357 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 OR4C45A6NMZ5 311 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV1-39P01597 117 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV1D-39P04432 117 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 OR56A5P0C7T3 313 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRC18Q8N456 261 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 DCAF4L2Q8NA75 395 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 GALMQ96C23 342 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 ROPN1LQ96C74 230 aa3.24□□□□□ -1.89
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RABGGTB-204ENST00000461653 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 CNBD2Q96M20 576 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 ZFP92A6NM28 416 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 C9JQL5 133 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 CHST10O43529 356 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 KALRNO60229 2985 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV3-11P01762 117 aa3.24□□□□□ -1.89
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RABGGTB-204ENST00000461653 AKR1C3P42330 323 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 CXCL12P48061 93 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 INPP1P49441 399 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF83P51522 516 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 CCR6P51684 374 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 C9orf64Q5T6V5 341 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 DEFB124Q8NES8 71 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 CD200R1Q8TD46 325 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 ABHD14BQ96IU4 210 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 CYYR1Q96J86 154 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 ACER3Q9NUN7 267 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC23A2Q9UGH3 650 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 TAC3Q9UHF0 121 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAJC12Q9UKB3 198 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 NEU3Q9UQ49 428 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 FIS1Q9Y3D6 152 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC171Q6TFL3 1326 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 LAMA1P25391 3075 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 NOTCH2Q04721 2471 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 ASXL3Q9C0F0 2248 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 A8MT66 165 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 H7C1C5 153 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC17A3O00476 420 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 RGS5O15539 181 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 DEDDO75618 318 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 CCNKO75909 580 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-204ENST00000461653 CDRT1O95170 752 aa3.23□□□□□ -1.89
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