RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 PRNDQ9UKY0 176 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFA4O00483 81 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV3-48P01763 117 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 C8orf88P0DMB2 117 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 HRH1P35367 487 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 MFAP2P55001 183 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 LYG2Q86SG7 212 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM25AB3EWG3 89 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM25CB3EWG5 89 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM25GB3EWG6 89 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 UBE2CO00762 179 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 TSPAN4O14817 238 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 GNG7O60262 68 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM127O75204 238 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 PGAM2P15259 253 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 BMI1P35226 326 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 MFAP4P55083 255 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 KLK9Q2XQG4 91 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 SPINK9Q5DT21 86 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 TSC22D3Q99576 134 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A087WXM4 84 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 DBX1A6NMT0 343 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 K7EMT4 169 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 MT-CO2P00403 227 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 CTSGP08311 255 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 ADMP35318 185 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 PAFAH1B2P68402 229 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 Q6ZWC4 215 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 GALNT14Q96FL9 552 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF2Q99496 336 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 SMPXQ9UHP9 88 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 NUPR2A6NF83 97 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 C15orf61A6NNL5 157 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 K7EIM0 57 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 M0QYG6 137 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 HPGDSO60760 199 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 IFNA17P01571 189 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 NAT1P18440 290 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 SNCAP37840 140 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 VBP1P61758 197 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF124Q15973 351 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 OR1P1Q8NH06 330 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF183Q96D59 192 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 YIPF6Q96EC8 236 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 ENY2Q9NPA8 101 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 C15orf62A8K5M9 175 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 MPTX1A8MV57 137 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 CHEK1O14757 476 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 ST8SIA3O43173 380 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 FGF2P09038 288 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 ELK1P19419 428 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 PI3P19957 117 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 RCVRNP35243 200 aa6.34□□□□□ -1.39
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