RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM187Q14656 261 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 MSMO1Q15800 293 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 MISP3Q96FF7 219 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 CNBD2Q96M20 576 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 SMPXQ9UHP9 88 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 DNAH2Q9P225 4427 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 K7EIM0 57 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 SNAPC5O75971 98 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 PSMB9P28065 219 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 TCTAP57738 103 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 PAFAH1B2P68402 229 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 POU2AF1Q16633 256 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 LEMD1Q68G75 181 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF773Q6PK81 442 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 TCF24Q7RTU0 167 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 HOGA1Q86XE5 327 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 C11orf94C9JXX5 98 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 F8W735 103 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 ST8SIA3O43173 380 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 KRASP01116 189 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV3-48P01763 117 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 G6PCP35575 357 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 DEFB131AP59861 70 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 MXD1Q05195 221 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 STHQ8IWL8 128 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM56Q96MV1 263 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 ATP6V0BQ99437 205 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 IFT46Q9NQC8 304 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 EHFQ9NZC4 300 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 RABAC1Q9UI14 185 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 APLNQ9ULZ1 77 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 ETV7Q9Y603 341 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 GNG7O60262 68 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 CTSGP08311 255 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 FGF2P09038 288 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 LPAR6P43657 344 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 MFAP4P55083 255 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 IDNKQ5T6J7 187 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 TPRA1Q86W33 373 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 NRG4Q8WWG1 115 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 ST8SIA2Q92186 375 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 BORCS5Q969J3 196 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 GINS3Q9BRX5 216 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 PRNDQ9UKY0 176 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.52□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 C15orf61A6NNL5 157 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 MT-CO2P00403 227 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 F2RP25116 425 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 HLA-DMBP28068 263 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 Q6ZTC4 211 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 OR1P1Q8NH06 330 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 SSR3Q9UNL2 185 aa7.51□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 DFFBO76075 338 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 GNRHRP30968 328 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 SDC2P34741 201 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 CBX5P45973 191 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 Q8NAQ8 132 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 OR4A16Q8NH70 328 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 OR10C1Q96KK4 312 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 TSC22D3Q99576 134 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms