RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058		C9JCJ5	164 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TOM1-210	ENST00000449058	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TOM1-210	ENST00000449058	SLC35E1	Q96K37	410 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TOM1-210	ENST00000449058	UHRF2	Q96PU4	802 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TOM1-210	ENST00000449058	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TOM1-210	ENST00000449058	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TOM1-210	ENST00000449058	PRRG2	O14669	202 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TOM1-210	ENST00000449058	BSPH1	Q075Z2	132 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TOM1-210	ENST00000449058	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TOM1-210	ENST00000449058	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF714	Q96N38	554 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TOM1-210	ENST00000449058		H0YJW9	148 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058		K7EN84	100 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	CCL3L1	P16619	93 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PNKD	Q8N490	385 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	JKAMP	Q9P055	326 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM178B	H3BS89	294 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ACTL6B	O94805	426 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	APOA2	P02652	100 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	GZMB	P10144	247 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	MGA	Q8IWI9	3026 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	OR10J1	P30954	320 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PPIAL4D	F5H284	164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	HNF1A	P20823	631 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PKIA	P61925	76 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	CD69	Q07108	199 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PSG5	Q15238	335 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF503	Q96F45	646 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	OR5G3	P0C626	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF596	Q8TC21	504 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	MLANA	Q16655	118 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	IL36B	Q9NZH7	164 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	CHRNB4	P30926	498 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	SSX8	Q7RTT4	187 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	GCG	P01275	180 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	DEFA6	Q01524	100 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00311	Q8N616	119 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058		Q8NA96	180 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM18	Q96B42	140 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	DLL1	O00548	723 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PAX1	P15863	534 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	OR4A5	Q8NH83	315 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	REG1B	P48304	166 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PSMB11	A5LHX3	300 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058		E7EUB6	86 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TSTD3	H0UI37	97 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFB3	O43676	98 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TAS2R45	P59539	299 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	SST	P61278	116 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	CCL17	Q92583	94 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM186	Q96B77	213 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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