RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTC9CQ8N5M4 171 aa13.35□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 LFNGQ8NES3 379 aa13.35□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR1L6Q8NGR2 347 aa13.35□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 AQP10Q96PS8 301 aa13.35□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAV3Q8IVL0 2385 aa13.35□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01548A6NM66 108 aa13.34□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BP45 60 aa13.34□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRYBA1P05813 215 aa13.34□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRYGCP07315 174 aa13.34□□□□□ -0.27
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NPY1RP25929 384 aa13.34□□□□□ -0.27
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ASPHD1Q5U4P2 390 aa13.34□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa13.34□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa13.34□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 STX12Q86Y82 276 aa13.34□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM252Q8N6L7 170 aa13.34□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF702PQ9H963 129 aa13.34□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV41A0A0B4J266 112 aa13.33□□□□□ -0.27
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ARPC5O15511 151 aa13.33□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYB5BO43169 146 aa13.33□□□□□ -0.27
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TOP3BP1-201ENST00000420768 APELAP0DMC3 54 aa13.33□□□□□ -0.27
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CTRB1P17538 263 aa13.33□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAXQ07812 192 aa13.33□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTRB2Q6GPI1 263 aa13.33□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZS46 218 aa13.33□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa13.33□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR1P1Q8NH06 330 aa13.33□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4C12Q96R67 309 aa13.33□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 P2RX4Q99571 388 aa13.33□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 GON7Q9BXV9 100 aa13.33□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF222A6NCQ9 220 aa13.32□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 C15orf62A8K5M9 175 aa13.32□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXO24O75426 580 aa13.32□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPAN9O75954 239 aa13.32□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 REG1AP05451 166 aa13.32□□□□□ -0.28
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TOP3BP1-201ENST00000420768 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2F1Q13607 317 aa13.32□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF345Q14585 488 aa13.32□□□□□ -0.28
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C19orf54Q5BKX5 351 aa13.32□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 PVRIGQ6DKI7 326 aa13.32□□□□□ -0.28
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MFFQ9GZY8 342 aa13.32□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa13.32□□□□□ -0.28
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TOP3BP1-201ENST00000420768 STPG2Q8N412 459 aa13.32□□□□□ -0.28
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TOP3BP1-201ENST00000420768 WNT10AQ9GZT5 417 aa13.32□□□□□ -0.28
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0D9SG52 128 aa13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 G3V318 75 aa13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFNA4P05014 189 aa13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL15P1P0C7V9 234 aa13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 HBG1P69891 147 aa13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 HBG2P69892 147 aa13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 ETV3LQ6ZN32 361 aa13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10P1Q8NGE3 313 aa13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2T6Q8NHC8 308 aa13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM170AQ8WVE7 144 aa13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSPB11Q9Y547 144 aa13.31□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 PMS2P5A8MQ11 134 aa13.3□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 CST7O76096 145 aa13.3□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRI3O95415 125 aa13.3□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 S100A11P31949 105 aa13.3□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLK9Q2XQG4 91 aa13.3□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZSV7 163 aa13.3□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNRGQ8N5I3 272 aa13.3□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5T1Q8NG75 326 aa13.3□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLK9Q9UKQ9 250 aa13.3□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BUA1 57 aa13.29□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXCL2P19875 107 aa13.29□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPIFP30405 207 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 NHLH2Q02577 135 aa13.29□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR8G2PQ6IF36 304 aa13.29□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9orf62Q8N4C0 152 aa13.29□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 GGACTQ9BVM4 153 aa13.29□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 C16orf95Q9H693 158 aa13.29□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 THYN1Q9P016 225 aa13.29□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00527Q9UJ94 153 aa13.29□□□□□ -0.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 MXRA5Q9NR99 2828 aa13.28□□□□□ -0.28
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