RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410938.1

RNU6-1328P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1328, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1328P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CGB7P0DN87 165 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GZMBP10144 247 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HLA-DMBP28068 263 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BAMBIQ13145 260 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF141Q15928 474 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MIAQ16674 131 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NDUFA5Q16718 116 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KHDC3LQ587J8 217 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TMEM78Q5T7P6 136 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 Q6ZS52 159 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ANGPTL5Q86XS5 388 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HIST3H2BBQ8N257 126 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LINC00471Q8N535 108 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DNAJC30Q96LL9 226 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HSPB9Q9BQS6 159 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DERL1Q9BUN8 251 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C11orf1Q9H5F2 150 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OSTCQ9NRP0 149 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NAT8Q9UHE5 227 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ASB4Q9Y574 426 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ANKRD12Q6UB98 2062 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CRB1P82279 1406 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SVILO95425 2214 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MYH2Q9UKX2 1941 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ARHGEF10O15013 1369 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DOCK9Q9BZ29 2069 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 A0A1W2PQD3 144 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SIGLEC16A6NMB1 481 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GGTLC3B5MD39 225 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 J3KT08 172 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SOD1P00441 154 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IGHV3-7P01780 117 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C1QBP02746 253 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DBIP07108 87 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BPGMP07738 259 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NBEAP1P0C6P0 100 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GZMHP20718 246 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NFYBP25208 207 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 XCL1P47992 114 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SRP9P49458 86 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RBM11P57052 281 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 UBE2BP63146 152 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MIR17HGQ75NE6 70 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TCF24Q7RTU0 167 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LHFPL1Q86WI0 220 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MSRB3Q8IXL7 192 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OSR2Q8N2R0 312 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RNF182Q8N6D2 247 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF283Q8N7M2 679 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR10P1Q8NGE3 313 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR8D4Q8NGM9 314 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR5C1Q8NGR4 320 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR5J2Q8NH18 312 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TMEM106AQ96A25 262 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PLEKHB2Q96CS7 222 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 AP1S3Q96PC3 154 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR8B2Q96RD0 313 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PFDN5Q99471 154 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DOHHQ9BU89 302 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TTTY13Q9BZ97 58 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TUBA4BQ9H853 241 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ANAPC11Q9NYG5 84 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PCTPQ9UKL6 214 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF835Q9Y2P0 537 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MEGF6O75095 1541 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MYH3P11055 1940 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SIPA1L1O43166 1804 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MYO10Q9HD67 2058 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NLRC5Q86WI3 1866 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NUP205Q92621 2012 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 A0A1W2PRE2 83 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRORSD1PA6NEY8 169 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 A8MU10 97 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 A8MUU9 505 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRAPPC2LH3BP13 241 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 H3BT86 120 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CST7O76096 145 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TCL1BO95988 128 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TFPTP0C1Z6 253 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 COX4I1P13073 169 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CCR2P41597 374 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FOXA1P55317 472 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PLCXD2Q0VAA5 305 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RTL8BQ17RB0 113 aa1.63□□□□□ -2.15
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RRN3P1Q2M238 152 aa1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms