RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 DRAM1Q8N682 238 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 LOXL4Q96JB6 756 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TCF19Q9Y242 345 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SCN5AQ14524 2016 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PSMB11A5LHX3 300 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 GCHFRP30047 84 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 LEAP2Q969E1 77 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 LYPD3O95274 346 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 NABP2Q9BQ15 211 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PATE3B3GLJ2 98 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2CO00762 179 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PAX1P15863 534 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 STARD6P59095 220 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ARF6P62330 175 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 KLK15Q9H2R5 256 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PLXNA3P51805 1871 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 NIT1Q86X76 327 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WWC5 75 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 COLCA2A8K830 154 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 J3QRE1 110 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 CCL20P78556 96 aa7.52□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 TSC2P49815 1807 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 NBASA2RRP1 2371 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 FGF16O43320 207 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 ATP5G3P48201 142 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TMPRSS3P57727 454 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 CGB1A6NKQ9 187 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 Q5PR19 223 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PROB1E7EW31 1015 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 SERF1AO75920 110 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 SAP25Q8TEE9 199 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 PRR32B1ATL7 298 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 B9A039 149 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TDGF1P13385 188 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TFF3Q07654 80 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ICAM4Q14773 271 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 GDF15Q99988 308 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GUT8 65 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRM-202ENST00000400053 F8VWA3 439 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 CGAP01215 116 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 UCP1P25874 307 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 DTX2Q86UW9 622 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 NPIPB3Q92617 1050 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 IL36BQ9NZH7 164 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 SSC4DQ8WTU2 575 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 C5orf30Q96GV9 206 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 REG4Q9BYZ8 158 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 REG1AP05451 166 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 C18orf15Q96N68 181 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 GP6Q9HCN6 339 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.5□□□□□ -1.21
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