RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392249.6

STRADB-202, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-202ENST00000392249 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 UBE2G2P60604 165 aa14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 RNF212Q495C1 297 aa14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 YPEL4Q96NS1 127 aa14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 C11orf94C9JXX5 98 aa14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 WT1-ASQ06250 92 aa14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 GAMTQ14353 236 aa14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.95□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 A0A1W2PN81 502 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 B4DEV8 164 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 RBP4P02753 201 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 LIPFP07098 398 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 STAG3L2P0CL84 134 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 STAG3L3P0CL85 134 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 CHRNA7P36544 502 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 PRR20EP86478 221 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 PRR20CP86479 221 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 PRR20DP86480 221 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 PRR20BP86481 221 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 PRR20AP86496 221 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 PARLQ9H300 379 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 C1orf196B1AJZ1 125 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 GNLYP22749 145 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 CNTFRP26992 372 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 LGALS7P47929 136 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 RAB5BP61020 215 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 CD69Q07108 199 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 PNKDQ8N490 385 aa14.94□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 CST9LP1Q5W188 147 aa14.93□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 DTX2Q86UW9 622 aa14.93□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.93□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.93□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 NAT8Q9UHE5 227 aa14.93□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 CXorf1O96002 111 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 LINC00869P0C866 280 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 ATP5G3P48201 142 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 RPEQ96AT9 228 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 OR10J1P30954 320 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 MAS1LP35410 378 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 CDKN1AP38936 164 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 ARF6P62330 175 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 RHOBP62745 196 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 ELOBQ15370 118 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 ADIRFQ15847 76 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 Q8WTZ3 238 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 CHODLQ9H9P2 273 aa14.92□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 A0A1W2PPI3 338 aa14.91□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 ACTL6BO94805 426 aa14.91□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 REG1AP05451 166 aa14.91□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.91□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 C4orf17Q53FE4 359 aa14.91□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.91□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 ACY3Q96HD9 319 aa14.91□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 CXorf65A6NEN9 183 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 AGAP20933 346 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 NPPCP23582 126 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 FAM78BQ5VT40 261 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 TEX45Q8NA69 505 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 BIN3Q9NQY0 253 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 NDUFS7O75251 213 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 FOXH1O75593 365 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 CXCL1P09341 107 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 TNXAQ16473 311 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 SLC35E1Q96K37 410 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 SSX3Q99909 188 aa14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
STRADB-202ENST00000392249 AKAP6Q13023 2319 aa14.89□□□□□ -0.03
STRADB-202ENST00000392249 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.89□□□□□ -0.03
STRADB-202ENST00000392249 TSPAN9O75954 239 aa14.89□□□□□ -0.03
STRADB-202ENST00000392249 IGHV3-48P01763 117 aa14.89□□□□□ -0.03
STRADB-202ENST00000392249 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms