RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPO2Q5TGU0 170 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 AMTNQ6UX39 209 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM64Q6YI46 380 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1F12Q8NHA8 337 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ABRACLQ9P1F3 81 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 REV3LO60673 3130 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO7AQ13402 2215 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PRD5 423 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CEACAM18A8MTB9 384 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CHEK1O14757 476 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SEC11AP67812 179 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF85Q03923 595 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 LY6DQ14210 128 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 AGMATQ9BSE5 352 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PRORYQ9H606 182 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 STARD5Q9NSY2 213 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 APOA2P02652 100 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 NXPH1P58417 271 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 WFDC11Q8NEX6 87 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01548A6NM66 108 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 J3QQQ9 107 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PIN1P1O15428 100 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CRISP2P16562 243 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL34P49207 117 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SPEM2Q0P670 501 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GAPTQ8N292 157 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SCN2AQ99250 2005 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GWB2 263 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM250H0YL14 139 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 M0QYG6 137 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SIRPB1O00241 398 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
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RABGEF1-202ENST00000380828 NMSQ5H8A3 153 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PRO0461Q9UI25 63 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 DAPL1A0PJW8 107 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 J3QLW9 94 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 LYPD3O95274 346 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1L3Q8NH93 324 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PROCRQ9UNN8 238 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL24O00175 119 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf105O95561 183 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHMP01871 453 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CNTFRP26992 372 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 DRD3P35462 400 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PMCHL1Q16048 86 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 MORN4Q8NDC4 146 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.59□□□□□ -1.51
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RABGEF1-202ENST00000380828 PRR13Q9NZ81 148 aa5.59□□□□□ -1.51
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RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF6P10767 208 aa5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 EFNB2P52799 333 aa5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF721Q8TF20 911 aa5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 C20orf173Q96LM9 149 aa5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 C9orf85Q96MD7 179 aa5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 DSCR8Q96T75 97 aa5.59□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 PFN2P35080 140 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 PRR20CP86479 221 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR20DP86480 221 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 FBXL22Q6P050 247 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 MRGPREQ86SM8 312 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 OTOSQ8NHW6 89 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 DPH3Q96FX2 82 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 NUDT4Q9NZJ9 180 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.58□□□□□ -1.52
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