RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GW64 132 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 HMX3A6NHT5 357 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 UPK2O00526 184 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV1-51P01701 117 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 GP9P14770 177 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 UCP1P25874 307 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 SYNJ2BPP57105 145 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 DEFA1P59665 94 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 DEFA3P59666 94 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5G2Q06055 141 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 BAK1Q16611 211 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 RPEL1Q2QD12 228 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 C15orf32Q32M92 178 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 CENPSQ8N2Z9 138 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 TTC9CQ8N5M4 171 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 NECAP1Q8NC96 275 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM56Q96MV1 263 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 PDCD10Q9BUL8 212 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 THYN1Q9P016 225 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.86□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 C15orf61A6NNL5 157 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 E7EUB6 86 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 BMPR1BO00238 502 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 LYRM1O43325 122 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 OR2J3O76001 311 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFB6O95139 128 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 CDS2O95674 445 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC2P0DI81 140 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC2BP0DI82 140 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 DEFA4P12838 97 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 MYOD1P15172 320 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 AREGP15514 252 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 AKR1C4P17516 323 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 PI3P19957 117 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF585BQ52M93 769 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 TMED4Q7Z7H5 227 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 LGI3Q8N145 548 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 MRGPRFQ96AM1 343 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 SEC22AQ96IW7 307 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 OR51B2Q9Y5P1 312 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.85□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 RYR3Q15413 4870 aa5.85□□□□□ -1.47
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SGMS1-201ENST00000361543 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0B4J2A0 478 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 PPP5D1E7EU14 171 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 REG1AP05451 166 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 CRYGCP07315 174 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 OR5AC1P0C628 307 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 CTRB1P17538 263 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 PSMB6P28072 239 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 G6PCP35575 357 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 OR2B8PP59922 312 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 ID3Q02535 119 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 ASAH1Q13510 395 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 TATDN3Q17R31 274 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM268Q5VZI3 342 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 IL34Q6ZMJ4 242 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 COQ8AQ8NI60 647 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 TP53RKQ96S44 253 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 ASCL2Q99929 193 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 ENY2Q9NPA8 101 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 PEMTQ9UBM1 199 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 U3KQK5 164 aa5.84□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 CGB1A6NKQ9 187 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 UPK1BO75841 260 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-23P01764 117 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 CSN3P07498 182 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 CCR6P51684 374 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
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