RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ARL3P36405 182 aa11.38□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 PRCDQ00LT1 54 aa11.38□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB121Q5J5C9 76 aa11.38□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.38□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.38□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM56Q96MV1 263 aa11.38□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.38□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.38□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFA13Q9P0J0 144 aa11.38□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 ST8SIA3O43173 380 aa11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 B3GALNT1O75752 331 aa11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 CDS2O95674 445 aa11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV1-51P01701 117 aa11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 EDN2P20800 178 aa11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 AP3S2P59780 193 aa11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 BAK1Q16611 211 aa11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZRM9 215 aa11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 OR2C3Q8N628 320 aa11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 CXorf58Q96LI9 332 aa11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 K7EIM0 57 aa11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 GGCTO75223 188 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 ATG12O94817 140 aa11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 GPR183P32249 361 aa11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 FAUP35544 74 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM187Q14656 261 aa11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 FAM209BQ5JX69 171 aa11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHA3Q9HB20 300 aa11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 THYN1Q9P016 225 aa11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC3BP05452 202 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 GP9P14770 177 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 AKR1C4P17516 323 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 DHODHQ02127 395 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 TATDN3Q17R31 274 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM268Q5VZI3 342 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 SGPP2Q8IWX5 399 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 OR1P1Q8NH06 330 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 GPR146Q96CH1 333 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 GALNT14Q96FL9 552 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 SORL1Q92673 2214 aa11.35□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 F8W735 103 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 CYB5BO43169 146 aa11.34□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 SLC35G3Q8N808 338 aa11.34□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF114Q8NC26 417 aa11.34□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.34□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 PEMTQ9UBM1 199 aa11.34□□□□□ -0.59
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 OR2T8A6NH00 312 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 IFNA17P01571 189 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 TRIQKQ629K1 86 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 GPHB5Q86YW7 130 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 FAM219AQ8IW50 185 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 MISP3Q96FF7 219 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 CACNG5Q9UF02 275 aa11.33□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM213A2RRL7 107 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 C2orf70A6NJV1 201 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 I3L2K1 104 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 LGALS9O00182 355 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 TGOLN2O43493 480 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 CCR6P51684 374 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 AARDQ4LEZ3 155 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf87Q6NUJ2 197 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 PLET1Q6UQ28 207 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 OR1L6Q8NGR2 347 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 IL22RA2Q969J5 263 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 CHRDL1Q9BU40 450 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.32□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.31□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 NXPH3O95157 252 aa11.31□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 MT-CO2P00403 227 aa11.31□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3-48P01763 117 aa11.31□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.31□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 UBAC2Q8NBM4 344 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms