RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 SSTR5P35346 364 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 GPR12P47775 334 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 SLAQ13239 276 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 PSG5Q15238 335 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 IFI44Q8TCB0 444 aa9.27□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 JPT1Q9UK76 154 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 CACNA1DQ01668 2161 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 GGTLC3B5MD39 225 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 IGLL1P15814 213 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 REG1BP48304 166 aa9.27□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 UBE2G1P62253 170 aa9.27□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.27□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 TMEM140Q9NV12 185 aa9.27□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 HSBP1O75506 76 aa9.26□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 CELA3AP09093 270 aa9.26□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 USF1P22415 310 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 FXYD3Q14802 87 aa9.26□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 TNXAQ16473 311 aa9.26□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 MAJINQ3KP22 176 aa9.26□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 LCN12Q6JVE5 192 aa9.26□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 VWA1Q6PCB0 445 aa9.26□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.26□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.25□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 J3QR06 171 aa9.25□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 TAS2R45P59539 299 aa9.25□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.25□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 OR2V2Q96R30 315 aa9.25□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.25□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa9.25□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.25□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 SLC35B1P78383 322 aa9.25□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 SPINK14Q6IE38 97 aa9.25□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZVH6 145 aa9.25□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.25□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.25□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 S1PR3Q99500 378 aa9.25□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 DEFB108AA8MXU0 73 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 AHRRA9YTQ3 701 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 M0R1X1 148 aa9.24□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 F2RL2O00254 374 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 OTX2P32243 289 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 PI4KAP42356 2102 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 POU2AF1Q16633 256 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 SMIM21Q3B7S5 101 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 WDR82Q6UXN9 313 aa9.24□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 OR4S2Q8NH73 311 aa9.24□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.24□□□□□ -0.93
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GINS3-202ENST00000328514 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 CXXC4Q9H2H0 198 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 IFI27L2Q9H2X8 130 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 ZNF596Q8TC21 504 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 USP24Q9UPU5 2620 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 R4GN57 208 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 PCSK5Q92824 1860 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-202ENST00000328514 A0A1B0GXF2 115 aa9.23□□□□□ -0.93
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