RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF439Q8NDP4 499 aa0.47□□□□□ -2.33
PDCL2-201ENST00000295645 AQP3Q92482 292 aa0.47□□□□□ -2.33
PDCL2-201ENST00000295645 CNBD2Q96M20 576 aa0.47□□□□□ -2.33
PDCL2-201ENST00000295645 EFCAB1Q9HAE3 211 aa0.47□□□□□ -2.33
PDCL2-201ENST00000295645 CKLFQ9UBR5 152 aa0.47□□□□□ -2.33
PDCL2-201ENST00000295645 C22orf24Q9Y442 160 aa0.47□□□□□ -2.33
PDCL2-201ENST00000295645 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
PDCL2-201ENST00000295645 DCCP43146 1447 aa0.47□□□□□ -2.33
PDCL2-201ENST00000295645 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 DENND4CQ5VZ89 1909 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 CEP192Q8TEP8 1941 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 TTC21AQ8NDW8 1320 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 A0A0D9SG52 128 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 H0Y980 276 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 M0QZ92 97 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 DCTN3O75935 186 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 DEXIO95424 95 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 TPM3P06753 285 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 KRT7P08729 469 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 HTR1AP08908 422 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 BRS3P32247 399 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 CCL20P78556 96 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 SPANXN5Q5MJ07 72 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 SPANXN3Q5MJ09 141 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 SYPL2Q5VXT5 272 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 LCN15Q6UWW0 184 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 DPPA3Q6W0C5 159 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 DEFB128Q7Z7B8 93 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 IQCF2Q8IXL9 164 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 DEFB125Q8N687 156 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 RASSF5Q8WWW0 418 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 RAB8BQ92930 207 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 LINC00526Q96FQ7 95 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 SCGB3A1Q96QR1 104 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 GINS4Q9BRT9 223 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa0.46□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 PIK3R4Q99570 1358 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 SCN3AQ9NY46 2000 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 EVPLLA8MZ36 301 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 CXCR6O00574 342 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 ACOX3O15254 700 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 COX5BP10606 129 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 MAP2K4P45985 399 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 NAA20P61599 178 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 TPM4P67936 248 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF846Q147U1 533 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 LPCAT3Q6P1A2 487 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 GID4Q8IVV7 300 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 C10orf67Q8IYJ2 551 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 COMMD5Q9GZQ3 224 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 KLK9Q9UKQ9 250 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 C9orf84Q5VXU9 1444 aa0.45□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 LAMA4Q16363 1823 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 ECM29Q5VYK3 1845 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 A0A0J9YY10 115 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 A0A1B0GX78 115 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 CLDN25C9JDP6 229 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 CETN3O15182 167 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 HYPMO75409 117 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 IFNA10P01566 189 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 ISG15P05161 165 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 HIST1H2BOP23527 126 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 RPS12P25398 132 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 HIST1H2BBP33778 126 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 HIST1H2BDP58876 126 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 RAB5BP61020 215 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 HIST1H2BCP62807 126 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 KISS1Q15726 138 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 KCNJ8Q15842 424 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 HIST2H2BEQ16778 126 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 AADACL3Q5VUY0 350 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 LPCAT4Q643R3 524 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 Q6ZS49 121 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF826PQ6ZT77 177 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 OOSP2Q86WS3 158 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 C1orf158Q8N1D5 194 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 OR4E2Q8NGC2 313 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 HIST1H2BHQ93079 126 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 OPTNQ96CV9 577 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 HIST1H2BNQ99877 126 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 HIST1H2BMQ99879 126 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 MIXL1Q9H2W2 232 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 USP24Q9UPU5 2620 aa0.44□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 CACNA1BQ00975 2339 aa0.43□□□□□ -2.34
PDCL2-201ENST00000295645 EVC2Q86UK5 1308 aa0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms