RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGHV1-2P23083 117 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ARPC1AQ92747 370 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CHST5Q9GZS9 411 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 M0R1W7 72 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGHV3-13P01766 116 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGHV3-7P01780 117 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 GPR183P32249 361 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 UBE2V1Q13404 147 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 POC1AQ8NBT0 407 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 LINC01587Q99440 93 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SOCS1O15524 211 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TMEM50BP56557 158 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 DUX3Q96PT4 197 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 J3KRW8 73 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 APOMO95445 188 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGKV1D-33P01593 117 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGKV1-33P01594 117 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ESDP10768 282 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CBLN1P23435 193 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CACNA1CQ13936 2221 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 C7orf71A4D174 169 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 H7C1H1 209 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 J3QR06 171 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGHMP01871 453 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 A0A0U1RQV5 110 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.359e-6■□□□□ 10.4
USP3-201ENST00000268049 SNAI2O43623 268 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIST1H2BKO60814 126 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 PPYP01298 95 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIST1H2BJP06899 126 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MGPP08493 103 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIST1H2BOP23527 126 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIST1H2BBP33778 126 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 LEPP41159 167 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIST1H2BDP58876 126 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIST1H2BCP62807 126 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 GAPTQ8N292 157 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TNFRSF14Q92956 283 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MPDU1O75352 247 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 CELA3AP09093 270 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 KCNS1Q96KK3 526 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 HYPMO75409 117 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 EFNB2P52799 333 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SELENOTP62341 195 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 FUT5Q11128 374 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 ITGB1BP1O14713 200 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 NTN1O95631 604 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 IGHG3P01860 377 aa6.58□□□□□ -1.36
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