RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 AKAP13Q12802 2813 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 C15orf65H3BRN8 121 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 GGCTO75223 188 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 TAS2R60P59551 318 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 TRAT1Q6PIZ9 186 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 SNHG12Q9BXW3 62 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 K7EN84 100 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 RANP62826 216 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 HCP5Q6MZN7 132 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 SPG11Q96JI7 2443 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 IGF2RP11717 2491 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 PYYP10082 97 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 TPPP2P59282 170 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 RPEL1Q2QD12 228 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 OR5AU1Q8NGC0 362 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 OR5R1Q8NH85 324 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-201ENST00000259365 M0R296 226 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 VENTXO95231 258 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 OPRK1P41145 380 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 LGALS4P56470 323 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 VAMP8Q9BV40 100 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 IFI27L2Q9H2X8 130 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 RELNP78509 3460 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 M0R143 59 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 STAG3L2P0CL84 134 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 STAG3L3P0CL85 134 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 CD24P25063 80 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 SRIP30626 198 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 CCKARP32238 428 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 KIR3DL3Q8N743 410 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 ASCL2Q99929 193 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV3-15P01624 115 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 FAM90A1Q86YD7 464 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 STARD4Q96DR4 205 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 HARBI1Q96MB7 349 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 TXN2Q99757 166 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 DSCAMO60469 2012 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 LEMD1Q68G75 181 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 ERASQ7Z444 233 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 OR10X1Q8NGY0 326 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 PYGO2Q9BRQ0 406 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 LRBAP50851 2863 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 C22orf34Q6ZV56 151 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 Q6ZWC4 215 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 HES4Q9HCC6 221 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 MUC6Q6W4X9 2439 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 P0C879 139 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 TPPP3Q9BW30 176 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 PRR33A8MZF0 331 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 GNG5P63218 68 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 NPIPB3Q92617 1050 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 JPT1Q9UK76 154 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 SRRM5B3KS81 715 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 MFAP2P55001 183 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 MORN5Q5VZ52 161 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 LCN12Q6JVE5 192 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM68Q96MH6 324 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 GNB4Q9HAV0 340 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 CSMD1Q96PZ7 3565 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 DIRC3C9JPN6 131 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 COX7A2P2O60397 106 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 MOSP00540 346 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF137PP52743 207 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 TCTAP57738 103 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 RPL15P61313 204 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 LCN2P80188 198 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 RTL8BQ17RB0 113 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 IGFBPL1Q8WX77 278 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM106BQ9NUM4 274 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 RNF7Q9UBF6 113 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 LOXL3P58215 753 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-201ENST00000259365 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms