RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 LCN2P80188 198 aa8.82□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.82□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.82□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.82□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.82□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.82□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 BRS3P32247 399 aa8.82□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 PAX5Q02548 391 aa8.82□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.82□□□□□ -1
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PRRX1-201ENST00000239461 RUNX1Q01196 453 aa8.81□□□□□ -1
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PRRX1-201ENST00000239461 MS4A10Q96PG2 267 aa8.81□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.81□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 A0A0U1RQK1 487 aa8.81□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 OR5G3P0C626 314 aa8.81□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.81□□□□□ -1
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PRRX1-201ENST00000239461 PPP5D1E7EU14 171 aa8.81□□□□□ -1
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PRRX1-201ENST00000239461 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.8□□□□□ -1
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PRRX1-201ENST00000239461 TMEM178BH3BS89 294 aa8.78□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 J3QR06 171 aa8.78□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 FAM157CP0CG43 387 aa8.78□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 CEACAM3P40198 252 aa8.78□□□□□ -1
PRRX1-201ENST00000239461 PLP1P60201 277 aa8.78□□□□□ -1
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