RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 TMEM128Q5BJH2 165 aa17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 TMED4Q7Z7H5 227 aa17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 OR2C3Q8N628 320 aa17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 IL22RA2Q969J5 263 aa17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 CCDC140Q96MF4 163 aa17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 BMPR1BO00238 502 aa17.08■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 OVOL1O14753 267 aa17.08■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 NDUFB6O95139 128 aa17.08■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 FAM219AQ8IW50 185 aa17.08■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 SLC35G3Q8N808 338 aa17.08■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 FLVCR2Q9UPI3 526 aa17.08■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 S4R3C0 116 aa17.08■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 MFSD2BA6NFX1 497 aa17.07■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-23P01764 117 aa17.07■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 SPINK9Q5DT21 86 aa17.07■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 LYZL2Q7Z4W2 148 aa17.07■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 CCDC32Q9BV29 185 aa17.07■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 SEC14L6B5MCN3 397 aa17.06■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 INS-IGF2F8WCM5 200 aa17.06■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 ZP3P21754 424 aa17.06■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD55Q3KP44 614 aa17.06■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 NMSQ5H8A3 153 aa17.06■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 ACSM6Q6P461 480 aa17.06■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 A0A0B4J2A0 478 aa17.05■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R1AQ13522 171 aa17.05■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 C9orf66Q5T8R8 295 aa17.05■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A24Q6NUK1 477 aa17.05■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 IL34Q6ZMJ4 242 aa17.05■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 CENPSQ8N2Z9 138 aa17.05■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 ZNF114Q8NC26 417 aa17.05■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 ZNF502Q8TBZ5 544 aa17.05■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 S100ZQ8WXG8 99 aa17.05■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 SHPKQ9UHJ6 478 aa17.05■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 PPP5D1E7EU14 171 aa17.04■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 SFT2D2O95562 160 aa17.04■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 MECP2P51608 486 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 LGI3Q8N145 548 aa17.04■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 LRTM2Q8N967 370 aa17.04■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 OR1P1Q8NH06 330 aa17.04■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 OR52E5Q8NH55 327 aa17.04■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 GPR61Q9BZJ8 451 aa17.04■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 CACNG5Q9UF02 275 aa17.04■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 CENPXA8MT69 81 aa17.03■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 K7EIM0 57 aa17.03■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 LYRM1O43325 122 aa17.03■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 ANXA3P12429 323 aa17.03■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 PVRIGQ6DKI7 326 aa17.03■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 CLEC19AQ6UXS0 136 aa17.03■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 VN1R17PQ8TDU5 208 aa17.03■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa17.03■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHA3Q9HB20 300 aa17.03■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 IFNA17P01571 189 aa17.02■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 CLEC3BP05452 202 aa17.02■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 SYNJ2BPP57105 145 aa17.02■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 CXorf58Q96LI9 332 aa17.02■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 THYN1Q9P016 225 aa17.02■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D24Q9ULP9 559 aa17.02■□□□□ 0.32
SYF2-201ENST00000236273 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa17.01■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 F8W735 103 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 VAMP1P23763 118 aa17.01■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 SPCS3P61009 180 aa17.01■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 SRPXP78539 464 aa17.01■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 ERHP84090 104 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 IFITM3Q01628 133 aa17.01■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 RPEL1Q2QD12 228 aa17.01■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 FAM209BQ5JX69 171 aa17.01■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 OR1L6Q8NGR2 347 aa17.01■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 SCARB1Q8WTV0 552 aa17.01■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa17■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 C9orf170A2RU37 121 aa17■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 I3L2K1 104 aa17■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 OR2C1O95371 312 aa17■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 INSL3P51460 131 aa17■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 BSXQ3C1V8 233 aa17■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 GGCTO75223 188 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 SULT1A3P0DMM9 295 aa16.99■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 SULT1A4P0DMN0 295 aa16.99■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 ZNF846Q147U1 533 aa16.99■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 C11orf87Q6NUJ2 197 aa16.99■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 OR9G4Q8NGQ1 327 aa16.99■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa16.98■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa16.98■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 CYB5BO43169 146 aa16.98■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 PITX3O75364 302 aa16.98■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 SAP30O75446 220 aa16.98■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 CSN3P07498 182 aa16.98■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 OR4E1P0C645 316 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms