RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 COA4Q9NYJ1 87 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PLXNB1O43157 2135 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GW64 132 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 HMX3A6NHT5 357 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CGB1A6NKQ9 187 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TEX22C9J3V5 150 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 G3V318 75 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PITX3O75364 302 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SCGB1D2O95969 90 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 IGF1P05019 195 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 REG1AP05451 166 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PRCDQ00LT1 54 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 FCN2Q15485 313 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 STPG2Q8N412 459 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 LFNGQ8NES3 379 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 LINC01006Q8NI28 216 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 C16orf95Q9H693 158 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.7□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TNCP24821 2201 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PN81 502 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 AREGP15514 252 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CXCL3P19876 107 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CHRNA7P36544 502 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 H2BFSP57053 126 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SPCS3P61009 180 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TNFRSF9Q07011 255 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 AARDQ4LEZ3 155 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR5T1Q8NG75 326 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR52E5Q8NH55 327 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 C2orf50Q96LR7 162 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 MDFIQ99750 246 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 RBKSQ9H477 322 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ENY2Q9NPA8 101 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.69□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PSMB11A5LHX3 300 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 MED6O75586 246 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR13C7P0DN81 318 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PSMB6P28072 239 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 S100A10P60903 97 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SLC35B1P78383 322 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 WT1-ASQ06250 92 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF329Q86UD4 541 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 DTD1Q8TEA8 209 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM68Q96MH6 324 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 GON7Q9BXV9 100 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF580Q9UK33 172 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 RNF114Q9Y508 228 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 JMJD1CQ15652 2540 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GVG6 124 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 WRBO00258 174 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SYNGR2O43760 224 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SSSCA1O60232 199 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 PRH1P02810 166 aa6.67□□□□□ -1.34
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